More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1936 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  100 
 
 
165 aa  344  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  87.88 
 
 
170 aa  315  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  86.67 
 
 
165 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  86.06 
 
 
165 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  80.61 
 
 
165 aa  292  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  81.82 
 
 
165 aa  290  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  81.21 
 
 
165 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  81.21 
 
 
165 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  80.61 
 
 
165 aa  287  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  64.02 
 
 
166 aa  228  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  59.39 
 
 
171 aa  213  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  58.18 
 
 
166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  59.26 
 
 
174 aa  209  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  56.97 
 
 
166 aa  204  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  59.64 
 
 
167 aa  201  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
175 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
178 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
174 aa  105  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  37.13 
 
 
174 aa  103  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  35.42 
 
 
201 aa  102  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
181 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  32.91 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
181 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
187 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
207 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
189 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
176 aa  87.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
177 aa  87  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  37.09 
 
 
185 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
175 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3536  acetyltransferase  29.45 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  33.11 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  33.33 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  33.56 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  33.75 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  27.63 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  27.33 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  26.71 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
189 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  31.72 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.03 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  31.72 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  33.12 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1537  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  31.72 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  31.72 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  31.03 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.03 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  32.3 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  31.03 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  31.03 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.06 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
192 aa  77.4  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  29.94 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  30.56 
 
 
175 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  31.71 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  31.41 
 
 
195 aa  77.4  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  29.94 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  29.17 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  29.17 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0775  SSU ribosomal protein S5P alanine acetyltransferase  35.42 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>