More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2013 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  59.55 
 
 		 188 aa  216  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  59.78 
 
 		 180 aa  211  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  58.66 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  47.13 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  47.13 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  46.7 
 
 		 185 aa  148  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  45.45 
 
 		 178 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  48.88 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  43.72 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  45.98 
 
 		 192 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  45.45 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  42.7 
 
 		 189 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  42.13 
 
 		 188 aa  131  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  41.57 
 
 		 189 aa  131  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  41.53 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  41.76 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 		 189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  43.1 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  41.01 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  40.34 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 		 204 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 		 187 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  42.86 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  44.69 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  43.09 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  35.8 
 
 		 186 aa  116  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  38.95 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 		 185 aa  112  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  37.1 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  38.37 
 
 		 182 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 		 189 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 		 189 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 		 187 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  40.68 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  41.14 
 
 		 184 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  37.22 
 
 		 184 aa  107  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 		 170 aa  104  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  41.76 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 		 296 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  42.4 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 		 318 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  33.7 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.71 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  34.97 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  33.69 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  33.69 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3228  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  35.5 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0919  hypothetical protein  30.97 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  35.95 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  30.86 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  27.52 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.79 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3517  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.21 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  33.56 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1507  putative acetyltransferase  29.8 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.46 
 
 		 396 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 		 167 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  28.21 
 
 		 168 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1733  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 		 167 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  34.42 
 
 		 167 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  28.06 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  32.41 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2946  acetyltransferase, GNAT family  32.1 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000111419  decreased coverage  0.00000000013504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  32.89 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>