More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1088 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  358  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  53.98 
 
 
185 aa  170  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  42.53 
 
 
178 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  43.43 
 
 
177 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  45.35 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  46.29 
 
 
184 aa  135  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  41.71 
 
 
182 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  40.57 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  39.55 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  41.95 
 
 
190 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  45.35 
 
 
189 aa  131  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  45.35 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  45.35 
 
 
189 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  40 
 
 
185 aa  127  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  37.36 
 
 
186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  40.59 
 
 
185 aa  124  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  39.08 
 
 
188 aa  124  9e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  45.93 
 
 
188 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  42.46 
 
 
194 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
190 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  41.38 
 
 
196 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
189 aa  121  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  41.71 
 
 
195 aa  121  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  39.08 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  40.8 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  42.2 
 
 
186 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  37.79 
 
 
187 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  40.7 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 
190 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  37.87 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
189 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  36.42 
 
 
189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
189 aa  111  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  42.37 
 
 
188 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  34.86 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
191 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 
180 aa  107  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  39.53 
 
 
204 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
184 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
192 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
187 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  41.52 
 
 
186 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
181 aa  99  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  38.78 
 
 
146 aa  98.2  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
178 aa  90.9  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  35.03 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  35.03 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  39.6 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  35.17 
 
 
201 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
296 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  38.39 
 
 
172 aa  85.5  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  36.2 
 
 
207 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  35.95 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  30.51 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
318 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6386  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
196 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00725822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  40.27 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0919  hypothetical protein  32.21 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  30.61 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.26 
 
 
396 aa  74.7  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  40.22 
 
 
285 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  33.11 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  28.77 
 
 
601 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.0203096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  32.28 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1291  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000284437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>