More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4775 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  94.15 
 
 
189 aa  363  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  90.96 
 
 
190 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  93.22 
 
 
178 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  72.49 
 
 
189 aa  292  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  70.9 
 
 
189 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  73.26 
 
 
189 aa  284  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  59.89 
 
 
186 aa  209  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  54.3 
 
 
188 aa  196  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  54.64 
 
 
187 aa  193  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  49.72 
 
 
178 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  51.1 
 
 
192 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  51.35 
 
 
181 aa  178  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  51.4 
 
 
196 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  49.45 
 
 
195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  50.84 
 
 
196 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  51.91 
 
 
190 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  47.19 
 
 
195 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  45.2 
 
 
188 aa  168  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  48.26 
 
 
187 aa  166  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  48.59 
 
 
184 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  44.13 
 
 
190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  44.81 
 
 
186 aa  159  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
177 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  46.74 
 
 
192 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  46.07 
 
 
189 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  44.83 
 
 
181 aa  156  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  46.89 
 
 
183 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  45.36 
 
 
186 aa  150  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  45.56 
 
 
204 aa  151  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  43.48 
 
 
184 aa  148  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 
194 aa  147  9e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  43.6 
 
 
182 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  43.02 
 
 
182 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  42.31 
 
 
188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  43.68 
 
 
185 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  43.26 
 
 
188 aa  136  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  41.88 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
189 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  41.14 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  41.01 
 
 
180 aa  131  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  41.48 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  43.82 
 
 
318 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  44.51 
 
 
296 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  37.85 
 
 
182 aa  120  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  45.89 
 
 
146 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  41.01 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  38.07 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  38.07 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
185 aa  117  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  45.67 
 
 
172 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  42.46 
 
 
285 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
170 aa  111  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  40.67 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
174 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  38.85 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  30.63 
 
 
171 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00124051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  32.96 
 
 
177 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.1 
 
 
170 aa  88.6  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
179 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  33.55 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
178 aa  79  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
175 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  32.48 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.48 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  35.2 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  28.67 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.0203096 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  32.46 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  32.52 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  31.76 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  28 
 
 
601 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  26.03 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
165 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>