More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3051 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
194 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  67.03 
 
 
185 aa  248  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  46.39 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  44.32 
 
 
190 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  41.48 
 
 
207 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  43.02 
 
 
178 aa  136  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
181 aa  111  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  38.2 
 
 
185 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
180 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  37.76 
 
 
201 aa  102  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  36.55 
 
 
201 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  37.89 
 
 
178 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  37.89 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  36.65 
 
 
178 aa  96.7  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.54 
 
 
170 aa  93.6  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  37.5 
 
 
175 aa  92.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  31.03 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
168 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  33.79 
 
 
172 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
176 aa  85.5  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
177 aa  85.5  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  29.44 
 
 
189 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  31.84 
 
 
177 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  36.3 
 
 
177 aa  84.7  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
170 aa  84.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  31.64 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
174 aa  84  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
169 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  36 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  30.9 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  29.89 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  34.15 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.97 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  28.33 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  26.23 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0752  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
170 aa  77.4  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
173 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  34.23 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  29.35 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  34.23 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  28.49 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  34.23 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  36.73 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  33.56 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  33.76 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  32.87 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  33.56 
 
 
207 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  25.42 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4260  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  29.66 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  32.02 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
175 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  25.27 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  27.54 
 
 
396 aa  71.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1051  hypothetical protein  33.54 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2712  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.757846  normal  0.0335255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  28.97 
 
 
182 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  28.25 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  29.66 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  31.38 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  30.29 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  30.6 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  26.16 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  25.41 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6557  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1031  acetyltransferase  30.29 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1808  acetyltransferase  30.29 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1787  acetyltransferase  30.29 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.600218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1272  acetyltransferase  30.29 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.149301  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1760  acetyltransferase  30.29 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.319622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1960  acetyltransferase  30.29 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00531041  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  25.15 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0135  acetyltransferase  30.29 
 
 
184 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
173 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  26.39 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7056  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>