174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3879 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  349  1e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1051  hypothetical protein  59.65 
 
 
176 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2712  GCN5-related N-acetyltransferase  59.65 
 
 
176 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.757846  normal  0.0335255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  57.31 
 
 
176 aa  180  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0754  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
179 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  53.37 
 
 
171 aa  147  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0752  GCN5-related N-acetyltransferase  49.39 
 
 
170 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  45.73 
 
 
177 aa  133  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  43.9 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  42.42 
 
 
172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  42.6 
 
 
167 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  40 
 
 
201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  44.97 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  44.97 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  41.46 
 
 
175 aa  114  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  44 
 
 
181 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  43.98 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  44.06 
 
 
180 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  42.33 
 
 
169 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
184 aa  103  9e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  44.08 
 
 
183 aa  101  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  39.88 
 
 
166 aa  99  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  38.65 
 
 
207 aa  97.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
164 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 
180 aa  95.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0179  GCN5-related N-acetyltransferase  46.06 
 
 
186 aa  94.7  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1050  acetyltransferase  46.39 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 
176 aa  87.4  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
185 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2711  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.764957  normal  0.0336934 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  31.76 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
176 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  34.5 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.27 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  31.18 
 
 
196 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  30.59 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  30.81 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  32.95 
 
 
207 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  32.95 
 
 
207 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
166 aa  57.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
165 aa  57.4  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
177 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
165 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  32.37 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0068  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
166 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  32.95 
 
 
336 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  31.29 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  32.37 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  32.37 
 
 
225 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 
170 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
181 aa  55.1  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  28.18 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
196 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  24.22 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  25.16 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  25.16 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05693  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.71 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
187 aa  52.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.53 
 
 
175 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
171 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  24.53 
 
 
175 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.84 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  22.98 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  29.66 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5650  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  34.26 
 
 
188 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
191 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.98 
 
 
168 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000080  putative acetyltransferase  25.34 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  31.21 
 
 
195 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4413  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.275989 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
180 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
175 aa  47.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
189 aa  47.8  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  27.33 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  27.38 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1388  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>