More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3625 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  367  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  52.94 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  49.11 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  48.24 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  43.18 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6271  GCN5-related N-acetyltransferase  50.65 
 
 		 184 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6557  GCN5-related N-acetyltransferase  50.65 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7056  GCN5-related N-acetyltransferase  47.8 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  46.91 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 		 174 aa  158  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  41.18 
 
 		 207 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  41.18 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  41.18 
 
 		 336 aa  154  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  46.3 
 
 		 171 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  40.59 
 
 		 225 aa  153  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  40.59 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  40.59 
 
 		 204 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  45.86 
 
 		 177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6553  GCN5-related N-acetyltransferase  50.33 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1278  GCN5-related N-acetyltransferase  50.33 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6159  GCN5-related N-acetyltransferase  50.33 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.887134  normal  0.0717303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  40.46 
 
 		 178 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1388  GCN5-related N-acetyltransferase  44.79 
 
 		 176 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 		 207 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  30.52 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  37.91 
 
 		 180 aa  88.6  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  36.24 
 
 		 177 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  35.57 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  34 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  29.76 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  31.74 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0754  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  35.57 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  34.23 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  35.57 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  27.71 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  28 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  30.26 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  30.32 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0068  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  27.71 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.12 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.41 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  33.12 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  27.11 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  27.11 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  27.11 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.11 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  26.51 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  32.21 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  33.33 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  30.2 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05770  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.14 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.732888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  26.71 
 
 		 396 aa  61.6  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  28.19 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4261  acetyltransferase  27.11 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  28.93 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  28.12 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  32 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>