More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1793 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  57.4 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  52.94 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  52.54 
 
 		 178 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  49.71 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  52.1 
 
 		 174 aa  180  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  53.21 
 
 		 177 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  47.56 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  47.95 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  45.12 
 
 		 171 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  47.37 
 
 		 336 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  47.37 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  46.78 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  46.78 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  46.78 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7056  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  44.97 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6271  GCN5-related N-acetyltransferase  45.14 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  43.2 
 
 		 178 aa  154  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6557  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 		 175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1388  GCN5-related N-acetyltransferase  41.98 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6553  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1278  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 		 188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6159  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 		 188 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.887134  normal  0.0717303 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 181 aa  99  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  33.33 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  33.33 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  36.84 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  33.75 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  29.71 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  31.65 
 
 		 166 aa  70.9  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  32.89 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  35.5 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.75 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0068  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.2 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  32.67 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  26.59 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  26.59 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  30.77 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  27.65 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  33.33 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  26.79 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  26.59 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  26.59 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  32.67 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  37.19 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  30.82 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  33.77 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  26.01 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  29.53 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4261  acetyltransferase  26.79 
 
 		 167 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  26.06 
 
 		 168 aa  62  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  32.89 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.81 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  23.49 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  35.78 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2558  hypothetical protein  36.46 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0371121  normal  0.114182 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  25.15 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  24.26 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  30.52 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>