More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2469 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 182 aa  381  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  57.39 
 
 		 178 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  59.09 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  57.39 
 
 		 178 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  57.95 
 
 		 178 aa  228  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  57.39 
 
 		 178 aa  220  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  57.39 
 
 		 178 aa  217  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  57.95 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  56.25 
 
 		 178 aa  213  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  58.76 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  52.27 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  51.18 
 
 		 183 aa  193  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  48.88 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  51.67 
 
 		 180 aa  184  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  46.55 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 		 171 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 171 aa  121  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  31.79 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  35.47 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  33.72 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 		 176 aa  87.4  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  31.84 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  34.66 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  28.25 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 169 aa  77  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3483  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000185806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  28.99 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.05 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  28.77 
 
 		 171 aa  72  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5548  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.664924 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  37.38 
 
 		 177 aa  71.6  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  28.67 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  28.9 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2487  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  28.9 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_267  acetyltransferase, GNAT family  27.78 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  28.9 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  28.9 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2034  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000135176  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.9 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  28.9 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0305  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  28.9 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2021  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0785  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.931422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.77 
 
 		 359 aa  67.8  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1567  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  28.32 
 
 		 180 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  33 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.6 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.32 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 179 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  33.98 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  32.02 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0706618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0195  acetyltransferase  29.5 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.92 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  30.48 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  30.65 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>