More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2618 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  49.14 
 
 
178 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  48.88 
 
 
182 aa  184  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  50.86 
 
 
178 aa  184  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  49.14 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  50.86 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  49.71 
 
 
178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  49.71 
 
 
178 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  49.71 
 
 
178 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  50.3 
 
 
183 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  47.43 
 
 
178 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  46.29 
 
 
177 aa  168  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  46.89 
 
 
180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  47.44 
 
 
178 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
179 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
175 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
179 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
171 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
171 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  31.76 
 
 
183 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  28.24 
 
 
175 aa  91.3  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  31.18 
 
 
171 aa  87.4  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  34.1 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  29.14 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  29.31 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  33.02 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0195  acetyltransferase  30.22 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.14 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  28.57 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  28.57 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  29.14 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.74 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  33.05 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  29.41 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0706618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  32.35 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.25 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  22.4 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  30.68 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0305  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  28.41 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  30.68 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.68 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  26.47 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  30.68 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  30.68 
 
 
176 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  31.9 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  27.06 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  27.06 
 
 
168 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  29.55 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
183 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
194 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
191 aa  62  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_267  acetyltransferase, GNAT family  26.63 
 
 
211 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0565  acetyltransferase  28.04 
 
 
165 aa  62.4  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00392228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 
185 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  30.41 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  25.99 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0368594 
 
 
-
 
NC_002950  PG1254  acetyltransferase  29.19 
 
 
175 aa  60.5  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  26.82 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0941  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
330 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1085  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
330 aa  60.5  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0616  acetyltransferase  26.32 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.98 
 
 
359 aa  60.1  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0140  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0185488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1571  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.32 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.71775  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0022  diamine N-acetyltransferase  29.73 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.246966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>