More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3517 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  56.82 
 
 
182 aa  203  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0368594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  57.3 
 
 
317 aa  202  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  58.72 
 
 
197 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  56.82 
 
 
194 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  56.82 
 
 
194 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  56.82 
 
 
194 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4413  GCN5-related N-acetyltransferase  55.31 
 
 
185 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.275989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0999  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303176  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
194 aa  197  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  55.68 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  52.78 
 
 
198 aa  191  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  49.72 
 
 
209 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  49.72 
 
 
210 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  49.72 
 
 
210 aa  170  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  40.98 
 
 
183 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  42.13 
 
 
199 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  43.27 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2973  GCN5-related N-acetyltransferase  37.06 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  35.52 
 
 
187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  35.36 
 
 
204 aa  105  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
181 aa  104  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
186 aa  104  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  36.56 
 
 
185 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  37.71 
 
 
184 aa  98.6  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  38.2 
 
 
380 aa  97.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1567  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
193 aa  96.3  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  33.92 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
200 aa  89  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.78 
 
 
198 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
185 aa  87.8  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4372  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3988  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2631  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.11 
 
 
180 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.985562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
177 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4749  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.98 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  28.41 
 
 
173 aa  82  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  27.33 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  28.41 
 
 
181 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0079  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.41 
 
 
173 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  27.33 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  27.33 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  27.33 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1494  GCN5-related N-acetyltransferase  29.12 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  27.33 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3575  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.580888  normal  0.0559642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.84 
 
 
173 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.41 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3462  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.26 
 
 
359 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  28.26 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2227  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  29.05 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3116  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5251  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0195  acetyltransferase  26.9 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5139  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124755  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  27.43 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5022  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0553  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2791  GCN5-related N-acetyltransferase  31.02 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.542192 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  26.34 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2206  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0244  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
184 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3192  GCN5-related N-acetyltransferase  25.14 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0402  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  29.21 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  22.67 
 
 
175 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.32 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  31.22 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  24.12 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>