More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2394 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
198 aa  412  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
194 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
194 aa  217  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0999  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
197 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303176  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  59.09 
 
 
197 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  58.52 
 
 
197 aa  214  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  56.32 
 
 
182 aa  201  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0368594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4413  GCN5-related N-acetyltransferase  54.24 
 
 
185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.275989 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  58.08 
 
 
317 aa  193  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  52.78 
 
 
186 aa  191  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  46.82 
 
 
210 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  42.71 
 
 
209 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  46.82 
 
 
210 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  42.13 
 
 
199 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
187 aa  134  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  37.85 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  40.34 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2973  GCN5-related N-acetyltransferase  34.3 
 
 
176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
185 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
196 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
181 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  32.6 
 
 
185 aa  95.1  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.23 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4749  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.86 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0079  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.07 
 
 
173 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.88 
 
 
359 aa  87.4  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  31.03 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  29.24 
 
 
173 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  28.65 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  28.07 
 
 
168 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  31.98 
 
 
175 aa  84.3  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1567  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  26.9 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  27.49 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0195  acetyltransferase  28.49 
 
 
189 aa  80.5  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  28.07 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  28.07 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.86 
 
 
380 aa  79  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  26.11 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  32.78 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
193 aa  77.8  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3988  GCN5-related N-acetyltransferase  28.27 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  43.02 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
208 aa  72  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2206  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1494  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5139  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124755  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
184 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2631  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.05 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.985562 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3462  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  22.95 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0390  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
178 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  23.86 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  24.28 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4372  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2487  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112226  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  29.74 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0402  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3116  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5251  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.72 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5022  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  24.42 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
176 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
286 aa  63.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
178 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
177 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13110  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.34 
 
 
208 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.615061  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
185 aa  63.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
225 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  33.66 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0927  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.84 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2283  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 
343 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
179 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
178 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>