More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4413 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4413  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
185 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.275989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  81.08 
 
 
182 aa  316  9e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0368594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
317 aa  227  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0999  GCN5-related N-acetyltransferase  56.32 
 
 
197 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303176  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  55.75 
 
 
194 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  55.75 
 
 
194 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  55.75 
 
 
194 aa  201  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  56.32 
 
 
197 aa  201  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  56.32 
 
 
197 aa  201  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  55.31 
 
 
186 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2394  GCN5-related N-acetyltransferase  54.24 
 
 
198 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  54.6 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  47.43 
 
 
209 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  47.43 
 
 
210 aa  168  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  47.43 
 
 
210 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  45.2 
 
 
199 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  41.76 
 
 
183 aa  148  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  44.26 
 
 
187 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2973  GCN5-related N-acetyltransferase  38.73 
 
 
176 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
198 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  37.64 
 
 
204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  36.22 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1567  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
196 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
181 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
185 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  34.09 
 
 
173 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  34.09 
 
 
173 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  33.52 
 
 
173 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  32.95 
 
 
181 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4749  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0079  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  33.91 
 
 
173 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  30.94 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  30.94 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2631  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.67 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.985562 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  30.94 
 
 
168 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  32.99 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  30.94 
 
 
168 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  30.39 
 
 
168 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.36 
 
 
359 aa  92  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3988  GCN5-related N-acetyltransferase  31.32 
 
 
197 aa  88.2  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3575  GCN5-related N-acetyltransferase  31.38 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.580888  normal  0.0559642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4372  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2791  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373361  normal  0.542192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  25.82 
 
 
185 aa  76.3  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.28 
 
 
380 aa  75.9  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0195  acetyltransferase  28.96 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1494  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3192  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2206  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0709005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  27.91 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0253  acetyltransferase  28.25 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2227  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
198 aa  71.2  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.254818  normal  0.014123 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
208 aa  70.9  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2029  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.73 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02170  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  41.3 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  28.73 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  28.73 
 
 
286 aa  68.6  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  26.37 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  28.73 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  28.73 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  28.18 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.73 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2283  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5022  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
178 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3462  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
180 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  28.96 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3116  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5251  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  28.18 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  28.18 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  28.18 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  26.7 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  25.86 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0062  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
187 aa  65.5  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  27.57 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5139  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.124755  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>