More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1834 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  370  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  82.58 
 
 
178 aa  308  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  80.9 
 
 
178 aa  303  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  81.46 
 
 
178 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  73.03 
 
 
178 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  73.45 
 
 
178 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  72.88 
 
 
178 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  72.88 
 
 
178 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  72.32 
 
 
178 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  58.52 
 
 
178 aa  233  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  56.25 
 
 
182 aa  213  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  50.57 
 
 
177 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  57.95 
 
 
178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  54.12 
 
 
183 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  49.14 
 
 
178 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  48.57 
 
 
180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  41.95 
 
 
179 aa  142  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  35.47 
 
 
175 aa  120  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  39.64 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  38.31 
 
 
171 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  37.11 
 
 
183 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  30 
 
 
175 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
176 aa  98.2  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
205 aa  87.8  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  33.92 
 
 
171 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
183 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
199 aa  84.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.02 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  31.46 
 
 
168 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  33.65 
 
 
188 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  30.77 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  29.38 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
193 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  29.38 
 
 
168 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  30.34 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  30.9 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  30.77 
 
 
187 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  31.46 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 
168 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  30.9 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_267  acetyltransferase, GNAT family  30.23 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0305  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
383 aa  74.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156025  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
196 aa  73.6  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  30.05 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  32.16 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  36.61 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2973  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0472391 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
215 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  31.58 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  31.58 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  30.46 
 
 
184 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  31.58 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  30.41 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5548  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.43 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  30.86 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>