More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1580 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  368  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  67.61 
 
 
178 aa  238  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  59.09 
 
 
178 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  61.36 
 
 
178 aa  235  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  57.95 
 
 
178 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  60.8 
 
 
178 aa  233  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  58.52 
 
 
178 aa  233  8e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
178 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  59.66 
 
 
178 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  57.39 
 
 
178 aa  231  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  59.09 
 
 
182 aa  229  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  61.36 
 
 
178 aa  229  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  53.01 
 
 
183 aa  197  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
177 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  47.43 
 
 
178 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  45.71 
 
 
180 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  40.8 
 
 
179 aa  139  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
171 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
179 aa  117  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  34.12 
 
 
175 aa  114  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  35.15 
 
 
171 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  33.53 
 
 
183 aa  106  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  35.26 
 
 
183 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
192 aa  89  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  30.41 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
186 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.21 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.44 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  34.66 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  34.66 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  34.66 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
317 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  27.11 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  30.05 
 
 
176 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  39.5 
 
 
183 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  29.24 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.09 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  31.94 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.94 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  26.16 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1523  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  29.21 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  29.21 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0785  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.931422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
185 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  29.21 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  29.78 
 
 
180 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19200  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.5 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208293  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  25.58 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.58 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  26.01 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
176 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  29.38 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.65 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
383 aa  64.3  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156025  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
369 aa  64.3  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1881  GCN5-related N-acetyltransferase  32.46 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.2 
 
 
338 aa  64.3  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  31.08 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0440  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  34.95 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  29.21 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3288  acetyltransferase, GNAT family  37.36 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>