More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2623 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
175 aa  360  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  57.31 
 
 
175 aa  209  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
178 aa  134  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
178 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
178 aa  129  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  36.78 
 
 
178 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
179 aa  121  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  35.47 
 
 
178 aa  120  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  36.57 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  35.23 
 
 
178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  34.12 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  36.31 
 
 
171 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
179 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
171 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
176 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
189 aa  94.7  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  42.06 
 
 
185 aa  89  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
185 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
183 aa  87.8  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
177 aa  86.7  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
187 aa  85.1  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
183 aa  84.3  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  37.68 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  27.49 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  36.09 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  35.29 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  35.29 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  35.29 
 
 
180 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.29 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
198 aa  78.2  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  31.32 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 
204 aa  77.8  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
205 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  29.71 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  24.42 
 
 
183 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  42.42 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  39.82 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  30.77 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  35.34 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0200  acetyltransferase  38.06 
 
 
184 aa  75.9  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.56 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
208 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 
317 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  40.19 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  26.55 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  38.89 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0961  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0164195  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 
197 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00275714  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  37.96 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  24.28 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0368594 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.01 
 
 
209 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0207  acetyltransferase  34.78 
 
 
187 aa  72  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.742792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 
173 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  26.32 
 
 
210 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  36.28 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0299  N-acetyltransferase  32.65 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.219282  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  25.29 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2314  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  0.0268854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  25.43 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3149  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000175005  hitchhiker  0.00000000160471 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.766793  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.437159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3530  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0324183  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6513  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00143605  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.083248  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  25 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2046  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.615867  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01543  hypothetical protein  30.43 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2293  diamine N-acetyltransferase  30.43 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000122818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0630  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1791  diamine N-acetyltransferase  30.43 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>