More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0534 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
203 aa  421  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  73.37 
 
 
204 aa  317  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  72 
 
 
204 aa  317  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  71.43 
 
 
204 aa  287  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  55.98 
 
 
206 aa  221  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  53.26 
 
 
206 aa  210  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  53.26 
 
 
206 aa  210  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  52.6 
 
 
198 aa  203  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  49.74 
 
 
195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  48.69 
 
 
195 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  47.09 
 
 
192 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  48.69 
 
 
195 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  49.74 
 
 
202 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.235365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  48.69 
 
 
194 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  48.69 
 
 
195 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  48.17 
 
 
194 aa  187  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  46.6 
 
 
195 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  50.28 
 
 
212 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  45.56 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  46.37 
 
 
194 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
202 aa  174  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.13 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  46.52 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  44.13 
 
 
194 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  43.46 
 
 
195 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  43.89 
 
 
196 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  42.78 
 
 
194 aa  165  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 
192 aa  162  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459408  hitchhiker  0.00554726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  35.68 
 
 
192 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0630  GCN5-related N-acetyltransferase  38.5 
 
 
219 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.2 
 
 
181 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.57 
 
 
181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01062  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2580  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.873673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2260  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1445  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.197686  hitchhiker  0.00299094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01070  hypothetical protein  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2080  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  35.16 
 
 
194 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.484761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2534  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.680812  normal  0.11611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2063  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.36 
 
 
194 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4288  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.171908  normal  0.472025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0732  GCN5-related N-acetyltransferase  42.55 
 
 
195 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.820091  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4666  GCN5-related N-acetyltransferase  39.05 
 
 
217 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868748  normal  0.839586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6644  GCN5-related N-acetyltransferase  41.45 
 
 
191 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1803  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  35.16 
 
 
194 aa  117  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5037  acetyltransferase, including N-acetylases of ribosomal protein  37.57 
 
 
188 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2795  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.85 
 
 
194 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.125941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1580  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0886  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2275  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.82 
 
 
194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.28 
 
 
221 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340541  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2021  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2179  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  35.14 
 
 
194 aa  112  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1264  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1279  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2205  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1235  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
194 aa  111  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0954445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
182 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 
182 aa  111  8.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  39.18 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3314  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.97 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2049  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.82 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0978  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2161  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.82 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350837  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2442  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.82 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306017  normal  0.727054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2863  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
205 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  34.54 
 
 
206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000395052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39580  ribosomal protein alanine acetyltransferase  38.6 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11013  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimJ  36.69 
 
 
217 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0249045  normal  0.821297 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
217 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0747  GCN5-related N-acetyltransferase  35.6 
 
 
215 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215795  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
200 aa  105  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113986  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  36.21 
 
 
207 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0906  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.6 
 
 
197 aa  105  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4451  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
215 aa  105  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3892  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
180 aa  104  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.618522  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0977  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
181 aa  104  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278975  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
295 aa  105  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4168  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
181 aa  104  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
210 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4053  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
180 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4369  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
180 aa  104  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.407529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4217  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  33.77 
 
 
180 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000303013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4279  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.77 
 
 
181 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0297691  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.06 
 
 
195 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3986  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.51 
 
 
221 aa  102  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0170  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
212 aa  102  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2842  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
183 aa  102  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01920  hypothetical protein  33.53 
 
 
194 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4258  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.11 
 
 
181 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0069  acetyltransferase  34.18 
 
 
312 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0794  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 
197 aa  101  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32650  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.42 
 
 
215 aa  101  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375064  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>