More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2161 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2442  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  100 
 
 
194 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306017  normal  0.727054 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2049  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  100 
 
 
194 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2161  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  100 
 
 
194 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2795  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  84.54 
 
 
194 aa  352  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.125941 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2275  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  78.35 
 
 
194 aa  334  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1580  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  76.29 
 
 
194 aa  329  1e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1803  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  77.84 
 
 
194 aa  329  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2080  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  77.32 
 
 
194 aa  327  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.484761  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2205  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  77.32 
 
 
194 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1279  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  77.32 
 
 
194 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1235  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  77.32 
 
 
194 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0954445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1264  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  77.32 
 
 
194 aa  325  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2179  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01062  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2580  GCN5-related N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.873673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1445  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.197686  hitchhiker  0.00299094 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2260  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2534  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.680812  normal  0.11611 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2063  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01070  hypothetical protein  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  75.77 
 
 
194 aa  323  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2021  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  76.8 
 
 
194 aa  320  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
179 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0978  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
179 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0863  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.33 
 
 
188 aa  170  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01920  hypothetical protein  45.16 
 
 
194 aa  167  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0927  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.2 
 
 
191 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6644  GCN5-related N-acetyltransferase  46.33 
 
 
191 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  47.46 
 
 
185 aa  164  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003166  ribosomal-protein-S5p-alanine acetyltransferase  42.47 
 
 
194 aa  160  8.000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0732  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
195 aa  157  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.820091  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3314  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  42.41 
 
 
199 aa  154  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  40.78 
 
 
192 aa  152  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0088  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 
205 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3339  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
197 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
295 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39580  ribosomal protein alanine acetyltransferase  42.78 
 
 
189 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5037  acetyltransferase, including N-acetylases of ribosomal protein  41.28 
 
 
188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  37.71 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 
148 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.151632  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  37.21 
 
 
204 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  34.54 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.43 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
194 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  35.39 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 
194 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
206 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.78 
 
 
195 aa  105  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
184 aa  104  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  32.26 
 
 
206 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 
206 aa  100  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
183 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
192 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
194 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01610  ribosomal protein alanine acetyltransferase  37.11 
 
 
207 aa  98.6  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
192 aa  97.1  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.444768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2842  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
183 aa  95.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
193 aa  94.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3986  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
181 aa  94.4  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3047  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
178 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0386186  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
194 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4279  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0297691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28 
 
 
181 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3892  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 
180 aa  91.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.618522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4168  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 
181 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4217  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  29.71 
 
 
180 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000303013  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.39 
 
 
181 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
195 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0977  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.29 
 
 
181 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278975  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4053  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4369  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.407529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  32.1 
 
 
173 aa  90.5  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113437  decreased coverage  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0069  acetyltransferase  28.72 
 
 
312 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6319  GCN5-related N-acetyltransferase  31.67 
 
 
206 aa  90.5  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640498  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.43 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
202 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.235365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
202 aa  89  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4258  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.29 
 
 
181 aa  89  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  0.20084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1239  acetyltransferase  37.72 
 
 
171 aa  88.6  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 
195 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0066  acetyltransferase  27.66 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  30.77 
 
 
221 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
207 aa  84.3  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0886  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4831  GCN5-related N-acetyltransferase  30.73 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340541  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>