More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0248 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
185 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 
179 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0978  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 
179 aa  191  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3314  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  48.39 
 
 
199 aa  191  8e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1580  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  49.42 
 
 
194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1235  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  48.86 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0954445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1264  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  48.86 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2205  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  48.86 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1279  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  48.86 
 
 
194 aa  171  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2021  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  48.86 
 
 
194 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0732  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
195 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.820091  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2795  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  47.43 
 
 
194 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.125941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01062  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2580  GCN5-related N-acetyltransferase  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.873673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2260  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2063  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2534  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.680812  normal  0.11611 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01070  hypothetical protein  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1445  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.76 
 
 
194 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.197686  hitchhiker  0.00299094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2049  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  47.46 
 
 
194 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2442  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  47.46 
 
 
194 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306017  normal  0.727054 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2161  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  47.46 
 
 
194 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2179  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  46.86 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2080  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.2 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.484761  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2275  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  46.29 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1803  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  45.2 
 
 
194 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6644  GCN5-related N-acetyltransferase  43.5 
 
 
191 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0088  GCN5-related N-acetyltransferase  43.53 
 
 
205 aa  158  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5037  acetyltransferase, including N-acetylases of ribosomal protein  42.86 
 
 
188 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  46.81 
 
 
148 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.151632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  41.01 
 
 
192 aa  147  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0863  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.11 
 
 
188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39580  ribosomal protein alanine acetyltransferase  43.86 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
295 aa  141  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003166  ribosomal-protein-S5p-alanine acetyltransferase  40.59 
 
 
194 aa  140  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01920  hypothetical protein  40.59 
 
 
194 aa  139  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3339  GCN5-related N-acetyltransferase  39.11 
 
 
197 aa  138  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0927  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.47 
 
 
191 aa  130  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0069  acetyltransferase  34.27 
 
 
312 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
184 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0066  acetyltransferase  34.27 
 
 
194 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
204 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0977  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.91 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278975  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.444768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
206 aa  111  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2842  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
183 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4258  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.76 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4217  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  33.33 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000303013  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  36.63 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4168  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.76 
 
 
181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4279  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0297691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3892  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.76 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.618522  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3986  GCN5-related N-acetyltransferase  32.76 
 
 
181 aa  108  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
192 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3047  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0386186  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4053  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.76 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4369  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.76 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.407529  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
183 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  37.79 
 
 
174 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
173 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113437  decreased coverage  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0194  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
202 aa  105  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3899  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.18 
 
 
181 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  35.06 
 
 
206 aa  104  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.06 
 
 
206 aa  104  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.71 
 
 
195 aa  104  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
189 aa  104  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  0.20084 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
195 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
194 aa  103  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
192 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459408  hitchhiker  0.00554726 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01610  ribosomal protein alanine acetyltransferase  35.95 
 
 
207 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
195 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
182 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
195 aa  101  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
202 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.235365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
195 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3895  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1239  acetyltransferase  34.07 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
194 aa  99  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
212 aa  99  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.95 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
202 aa  97.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3641  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
197 aa  97.8  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
193 aa  96.7  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.36 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  34 
 
 
195 aa  95.5  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  32.02 
 
 
194 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
194 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.34 
 
 
194 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  31.35 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4036  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
210 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1195  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.89265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>