More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4313 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4313  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  74.09 
 
 
194 aa  300  9e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.750296 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1833  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  74.09 
 
 
194 aa  298  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0482  GCN5-related N-acetyltransferase  74.09 
 
 
194 aa  298  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.15117  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  73.2 
 
 
194 aa  294  5e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  72.54 
 
 
194 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  72.25 
 
 
196 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3526  GCN5-related N-acetyltransferase  49.2 
 
 
212 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140052  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  46.52 
 
 
206 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  48.62 
 
 
192 aa  177  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 
198 aa  176  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.39 
 
 
206 aa  175  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  44.39 
 
 
206 aa  175  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  46.52 
 
 
203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0690  GCN5-related N-acetyltransferase  44.92 
 
 
204 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0633  GCN5-related N-acetyltransferase  44.92 
 
 
204 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0805493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  46.74 
 
 
204 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 
195 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  47.43 
 
 
195 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  46.86 
 
 
194 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0679  GCN5-related N-acetyltransferase  48.07 
 
 
195 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231722  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  48.28 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  47.43 
 
 
195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  45.14 
 
 
195 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  45.71 
 
 
195 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  44.63 
 
 
202 aa  159  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  45.93 
 
 
192 aa  156  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459408  hitchhiker  0.00554726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 
202 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.235365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  37.28 
 
 
195 aa  124  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.204345  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6319  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.640498  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4651  GCN5-related N-acetyltransferase  37.99 
 
 
192 aa  111  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.444768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6644  GCN5-related N-acetyltransferase  38.86 
 
 
191 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.664947  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  35.39 
 
 
218 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0886  GCN5-related N-acetyltransferase  35.6 
 
 
206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3025  GCN5-related N-acetyltransferase  30.27 
 
 
192 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4666  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
217 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868748  normal  0.839586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0794  GCN5-related N-acetyltransferase  39.33 
 
 
197 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0915  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 
207 aa  105  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2278  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
189 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.172331  normal  0.20084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.82 
 
 
221 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4288  GCN5-related N-acetyltransferase  36.2 
 
 
203 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  36.2 
 
 
203 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.171908  normal  0.472025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
210 aa  102  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0069  acetyltransferase  32.2 
 
 
312 aa  102  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0170  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
212 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1580  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  35.09 
 
 
194 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  35.58 
 
 
225 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0066  acetyltransferase  32.2 
 
 
194 aa  101  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4831  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
221 aa  101  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.340541  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
182 aa  100  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.482966  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30550  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.72 
 
 
227 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.926933  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2080  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.42 
 
 
194 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.484761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0630  GCN5-related N-acetyltransferase  35.36 
 
 
219 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01062  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2580  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.873673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2260  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2063  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.167866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1445  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.197686  hitchhiker  0.00299094 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1789  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166942  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1189  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01070  hypothetical protein  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2534  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  34.5 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.680812  normal  0.11611 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3339  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
197 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1803  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.42 
 
 
194 aa  99.4  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
173 aa  99  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113437  decreased coverage  0.00454433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
217 aa  99  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.260479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0838  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
200 aa  98.6  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0220221  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2275  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.75 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2021  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.92 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2205  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.92 
 
 
194 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1279  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.92 
 
 
194 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1264  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.92 
 
 
194 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.137217 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1235  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  33.92 
 
 
194 aa  98.2  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0954445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2838  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
295 aa  97.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2795  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.16 
 
 
194 aa  97.8  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.125941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1967  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 
204 aa  97.1  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
185 aa  96.7  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5037  acetyltransferase, including N-acetylases of ribosomal protein  33.71 
 
 
188 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.363067  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3314  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.88 
 
 
199 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0216774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0978  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3184  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4036  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
210 aa  95.9  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357695  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32650  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.375064  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2179  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.75 
 
 
194 aa  95.5  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443793  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  35.44 
 
 
200 aa  95.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.113986  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2049  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.94 
 
 
194 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8645  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11013  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimJ  34.39 
 
 
217 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0249045  normal  0.821297 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2161  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.94 
 
 
194 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350837  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0906  GCN5-related protein N-acetyltransferase  36.63 
 
 
197 aa  95.1  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.4451  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2442  ribosomal-protein-S5-alanine N-acetyltransferase  32.94 
 
 
194 aa  94.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306017  normal  0.727054 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0732  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
195 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.820091  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13110  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.91 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.615061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.720743 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.36 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2812  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0977  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.18 
 
 
181 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>