More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2455 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  367  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  95.51 
 
 
178 aa  352  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  93.26 
 
 
178 aa  347  5e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  80.9 
 
 
178 aa  303  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  75.14 
 
 
178 aa  288  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  74.58 
 
 
178 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  74.01 
 
 
178 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  74.01 
 
 
178 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  70.79 
 
 
178 aa  275  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1580  GCN5-related N-acetyltransferase  57.95 
 
 
178 aa  235  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0125256  normal  0.248889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  57.39 
 
 
182 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  55.29 
 
 
183 aa  202  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.152334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  58.52 
 
 
178 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  48.86 
 
 
177 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1263  acetyltransferase  49.71 
 
 
180 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173592 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2618  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.397987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 
179 aa  151  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
175 aa  132  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2273  GCN5-related N-acetyltransferase  41.42 
 
 
171 aa  123  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1796  GCN5-related N-acetyltransferase  39.77 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0920408  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2752  acetyltransferase  32.35 
 
 
175 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  36.59 
 
 
171 aa  105  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  35.47 
 
 
183 aa  103  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
183 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  34.71 
 
 
183 aa  98.2  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
176 aa  97.8  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  34.5 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
187 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
193 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  33.92 
 
 
187 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2854  GCN5-related N-acetyltransferase  32.16 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.931965  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
204 aa  88.6  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  31.64 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
186 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  84.7  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
205 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
189 aa  84.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  32.16 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
176 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  31.95 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  31.58 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  31.58 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  31.58 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  30.99 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.58 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
187 aa  81.6  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2859  acetyltransferase, GNAT family  29.82 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3204  GCN5-related N-acetyltransferase  25.14 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  29.31 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  30.9 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  32.05 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2474  acetyltransferase, GNAT family  29.82 
 
 
168 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
183 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  31.46 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.98 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  28.98 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0305  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  30.9 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3284  acetyltransferase, GNAT family  27.65 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  26.44 
 
 
185 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1374  GCN5-related N-acetyltransferase  31.4 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2004  acetyltransferase  28.98 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
174 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.34 
 
 
180 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  30.41 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  30.9 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  27.06 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  27.06 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  36.64 
 
 
198 aa  74.7  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3179  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
208 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
185 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3405  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000780456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0706618 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  41.51 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_267  acetyltransferase, GNAT family  29.89 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1047  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000813755  hitchhiker  0.000000247911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>