More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1896 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  53.04 
 
 
185 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  53.63 
 
 
180 aa  203  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  56.07 
 
 
183 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  56.07 
 
 
183 aa  194  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  53.45 
 
 
181 aa  193  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5603  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
183 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.40665  normal  0.677013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
183 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.265816  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4697  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
183 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.478188  normal  0.278503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  48.59 
 
 
183 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  47.46 
 
 
205 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  45.09 
 
 
187 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 
189 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1445  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
192 aa  150  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0179041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
185 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  43.93 
 
 
187 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  43.93 
 
 
187 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  43.93 
 
 
193 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  40.78 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0664869  normal  0.190912 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  34.86 
 
 
180 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  34.29 
 
 
180 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.29 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  34.29 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  34.29 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  35.91 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  37.36 
 
 
286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
195 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  32.96 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
188 aa  106  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 
196 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  29.94 
 
 
206 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5564  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
191 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295471  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
184 aa  102  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  40.34 
 
 
184 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2100  hypothetical protein  32.02 
 
 
186 aa  97.8  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  31.82 
 
 
177 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
182 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0478  GCN5-related N-acetyltransferase  33.7 
 
 
172 aa  95.9  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
193 aa  94.4  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1764  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
182 aa  94.4  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2946  acetyltransferase, GNAT family  32.56 
 
 
183 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000111419  decreased coverage  0.00000000013504 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
176 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  30.59 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  30 
 
 
176 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1259  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
189 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2175  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.98 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000924532  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  31.64 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3234  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.812854  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  29.41 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2519  acetyltransferase, GNAT family  31.98 
 
 
183 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000365018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  29.41 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.41 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  29.41 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  29.41 
 
 
176 aa  92.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  29.05 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
204 aa  91.7  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  32.96 
 
 
184 aa  91.3  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2452  acetyltransferase  31.4 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000462654  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2767  GCN5-related N-acetyltransferase  33.92 
 
 
172 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000158462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  28.49 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2255  acetyltransferase  31.4 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2214  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.4 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.09842e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2385  acetyltransferase, GNAT family  31.98 
 
 
183 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000643226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.82 
 
 
176 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2420  acetyltransferase  31.4 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772154  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  32.57 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  32.22 
 
 
188 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  32.07 
 
 
196 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2438  acetyltransferase, GNAT family  31.4 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.144947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2029  GCN5-related N-acetyltransferase  35.98 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2234  GCN5-related N-acetyltransferase  30.51 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000113859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  28.65 
 
 
182 aa  89  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
178 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31300  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.88 
 
 
203 aa  88.6  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00339223  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23000  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.81 
 
 
380 aa  88.6  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.713177  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.56 
 
 
359 aa  88.6  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
176 aa  88.2  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4687  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535947  hitchhiker  0.00121502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
187 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2475  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  34.22 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  32.8 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3740  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.67 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  30.23 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 
201 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.458682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>