More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_267 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_267  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
211 aa  434  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0305  GCN5-related N-acetyltransferase  86.26 
 
 
211 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
185 aa  104  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  31.43 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  31.43 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  31.43 
 
 
180 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  31.43 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.43 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  31.43 
 
 
180 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  32 
 
 
180 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
182 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  31.43 
 
 
180 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  34.97 
 
 
196 aa  91.7  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0342  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  28.49 
 
 
187 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  29.12 
 
 
206 aa  85.9  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  34.08 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0120  GCN5-related N-acetyltransferase  40.78 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0841  putative ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.87 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
166 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
184 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  27.27 
 
 
184 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  30.89 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
383 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156025  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  26.97 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0320  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 
199 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.810608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0597  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
206 aa  75.9  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310523  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0758  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  26.14 
 
 
187 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
195 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
176 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457106  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  30.23 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0824  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  26.55 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0487  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.01 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.19146  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0482  acetyltransferase  37.01 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  26.37 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  30.77 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
187 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  28.09 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3398  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.45 
 
 
165 aa  70.9  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0084357  normal  0.312955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  33.63 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0298  hypothetical protein  30 
 
 
178 aa  71.2  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  30.89 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4687  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
181 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535947  hitchhiker  0.00121502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.07 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0820  acetyltransferase  31.76 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal  0.0913574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0857  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6257  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  27.07 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449495  normal  0.0248336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  27.32 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4494  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0843  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
193 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296833  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0534  GCN5-related N-acetyltransferase  36.7 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0655  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2425  GCN5-related N-acetyltransferase  31.5 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3402  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.774509  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1073  ribosomal-protein (S5)-alanine N-acetyltransferase  31.06 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  35.24 
 
 
176 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  32.57 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0992  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.46 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31300  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.31 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00339223  normal  0.473848 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0467  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4320  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.01 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0977  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.75 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278975  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1513  acetyltransferase  31.25 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0154718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
199 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1253  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 
195 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.329985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>