More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_152 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
183 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  82.32 
 
 
184 aa  315  2e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  46.93 
 
 
193 aa  160  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  41.04 
 
 
177 aa  147  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  45.73 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  36.42 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  36.42 
 
 
181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  35.84 
 
 
182 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  36.52 
 
 
187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  36.72 
 
 
187 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  41.94 
 
 
177 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 
179 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  38.27 
 
 
184 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
185 aa  104  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  42.38 
 
 
209 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
174 aa  102  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  33.52 
 
 
180 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  34.08 
 
 
180 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  33.52 
 
 
180 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  33.52 
 
 
180 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  33.52 
 
 
180 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.52 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  33.52 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  33.52 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  35.39 
 
 
221 aa  96.7  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
196 aa  94.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.96 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
188 aa  93.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  37.33 
 
 
216 aa  92.4  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  37.33 
 
 
216 aa  92.4  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  35.36 
 
 
189 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 
202 aa  92  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 
231 aa  92  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  35.2 
 
 
210 aa  91.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
176 aa  91.7  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  34.66 
 
 
218 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  35.2 
 
 
218 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
173 aa  89.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  38.26 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  28.41 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
173 aa  88.2  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
182 aa  88.2  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  26.86 
 
 
206 aa  87.8  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
199 aa  87.4  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 
186 aa  87  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
177 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  33.11 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  37.58 
 
 
216 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  34.25 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
198 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  34.9 
 
 
199 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  32.96 
 
 
188 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  31.74 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
171 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
196 aa  82  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2808  GCN5-related N-acetyltransferase  36.61 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4903  acetyltransferase, gnat family  29.38 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00722603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4499  acetyltransferase  29.38 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4516  acetyltransferase  29.38 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_267  acetyltransferase, GNAT family  28.73 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  32.16 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  33.91 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  31.84 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  32.87 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  31.25 
 
 
202 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2100  hypothetical protein  29.38 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  32.08 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4913  acetyltransferase  30.51 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  31.25 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  31.15 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
376 aa  78.2  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4797  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0264  GCN5-related N-acetyltransferase  35.2 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0305  GCN5-related N-acetyltransferase  27.84 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  30.9 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  27.74 
 
 
347 aa  75.5  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0231  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.394828  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4576  GCN5-related N-acetyltransferase  33.6 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>