More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0248 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
198 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  85.43 
 
 
199 aa  350  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  80.71 
 
 
199 aa  334  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  71.72 
 
 
199 aa  300  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  73.6 
 
 
200 aa  296  9e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  67.51 
 
 
202 aa  280  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  68.34 
 
 
195 aa  265  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  50.25 
 
 
209 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  43.65 
 
 
218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  43.65 
 
 
218 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
213 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  45.56 
 
 
216 aa  142  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  42.86 
 
 
210 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  42.62 
 
 
197 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  40.45 
 
 
216 aa  134  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  39.89 
 
 
216 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  41.01 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 
199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
199 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  39.08 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
198 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  37.3 
 
 
214 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  102  4e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
176 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  36.24 
 
 
173 aa  89.4  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  33.55 
 
 
184 aa  87  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
174 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 
182 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  34.84 
 
 
171 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  33.11 
 
 
184 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  29.95 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  36.05 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  30.87 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  32.62 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  31.15 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  30.77 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  30.77 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  30.86 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  32.85 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0467  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 
176 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  31.08 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  31.93 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
182 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
178 aa  72  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.495125 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
167 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  36.96 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  26.4 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  28.85 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  32.22 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  34.23 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  30.67 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  27.32 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000882021  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05693  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.55 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  23.76 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  28.29 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1507  putative acetyltransferase  31.87 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1981  protein of unknown function DUF523  30.11 
 
 
354 aa  64.3  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0342  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1358  acetyltransferase  27.1 
 
 
226 aa  63.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.97 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
191 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  30.2 
 
 
185 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0305  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  26.95 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.37 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>