More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0425 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  68.34 
 
 
198 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  66.16 
 
 
199 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  65.48 
 
 
199 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  64.14 
 
 
200 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  63.5 
 
 
199 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  59.09 
 
 
202 aa  229  2e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  51.38 
 
 
209 aa  171  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  45.11 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  45.95 
 
 
216 aa  131  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
218 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  41.81 
 
 
197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
218 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
221 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  36.22 
 
 
210 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  37.22 
 
 
216 aa  115  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  37.22 
 
 
216 aa  114  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  38.92 
 
 
199 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  38.38 
 
 
199 aa  111  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
199 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  41.06 
 
 
177 aa  102  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
214 aa  97.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
198 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  33.54 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  40 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
176 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
218 aa  85.1  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  35.57 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  31.93 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  37.67 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  33.13 
 
 
183 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  33.57 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  28.86 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  36.09 
 
 
173 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  38.26 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
203 aa  71.2  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
187 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  34.57 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  33.14 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.495125 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  28.57 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  30.43 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  27.62 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 
198 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  27.62 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  29.09 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  31.91 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1465  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0333555 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 
171 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
185 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  33.63 
 
 
177 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
174 aa  63.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
215 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2075  hypothetical protein  32.37 
 
 
195 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2640  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
166 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0467  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 
176 aa  61.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  27.22 
 
 
188 aa  61.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
168 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1358  acetyltransferase  27.1 
 
 
226 aa  59.7  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.211341  normal  0.620155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
177 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  25.3 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
167 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
195 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.49 
 
 
175 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
178 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4628  GCN5-related N-acetyltransferase  28.02 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.398395  normal  0.333062 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  28.4 
 
 
201 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
178 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2167  hypothetical protein  31.79 
 
 
195 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.670672  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4591  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
187 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.280229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
179 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1731  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
185 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  26.35 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>