More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3893 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
190 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  62.58 
 
 
198 aa  187  7e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  46.82 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
177 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
174 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
231 aa  95.5  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  38.32 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  38.89 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  38.89 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
182 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
198 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  40.29 
 
 
195 aa  88.6  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
176 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  46.38 
 
 
169 aa  85.9  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  37.32 
 
 
197 aa  85.9  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
200 aa  85.5  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
173 aa  84  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
199 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  35.33 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  27.56 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  34.51 
 
 
184 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  36.31 
 
 
189 aa  77.8  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  35.25 
 
 
176 aa  77.4  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  36.97 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  33.12 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
193 aa  72  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  34.53 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  29.52 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  34.76 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  34.76 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  35.37 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  34.46 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  32.75 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  31.75 
 
 
166 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_002950  PG1358  acetyltransferase  31.06 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1465  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0333555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
185 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4738  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0124203 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 
204 aa  61.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457106  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  30.67 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2153  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4577  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
166 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000162939  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  33.81 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  49.3 
 
 
179 aa  58.9  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  26.67 
 
 
175 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  29.05 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  30.22 
 
 
163 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  30 
 
 
182 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.97 
 
 
175 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
176 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.14 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.66 
 
 
347 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4367  GCN5-related N-acetyltransferase  33.97 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1120  hypothetical protein  30.27 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2100  hypothetical protein  27.52 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2167  hypothetical protein  35.71 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.670672  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0585  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.424519  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
190 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
181 aa  55.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4221  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
183 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  25 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  25 
 
 
175 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>