140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1463 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
179 aa  363  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  69.66 
 
 
189 aa  261  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  66.48 
 
 
183 aa  243  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  69.33 
 
 
202 aa  240  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  69.33 
 
 
179 aa  240  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  62.87 
 
 
181 aa  226  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  57.3 
 
 
178 aa  212  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
176 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  35.57 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
174 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  34.01 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  32.08 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  28.97 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  29.14 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  29.27 
 
 
216 aa  67.8  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  31.97 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
218 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  27.53 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1465  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0333555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  35.66 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  27.27 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  35.71 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
199 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  27.78 
 
 
195 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
199 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
198 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
193 aa  62.4  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
197 aa  61.6  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
202 aa  61.2  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
199 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
198 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  25.88 
 
 
195 aa  60.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
198 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
157 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  28.93 
 
 
184 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
213 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
221 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
200 aa  55.1  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  27.67 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1902  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99979  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  25.88 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
175 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
428 aa  52.8  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.621487  normal  0.635347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  29.8 
 
 
187 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
176 aa  52.4  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3593  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  39.51 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6345  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.881821  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  39.51 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1358  acetyltransferase  24.5 
 
 
226 aa  49.3  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4280  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
188 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.426403  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.69 
 
 
175 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1206  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000216631  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  34.69 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
193 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.45 
 
 
347 aa  48.5  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  30.08 
 
 
163 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
177 aa  48.1  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  40.79 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1893  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
165 aa  48.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.993819  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2625  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
179 aa  47.8  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1120  hypothetical protein  27.03 
 
 
173 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
181 aa  47.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  24.5 
 
 
182 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  23.57 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  40.79 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
205 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2015  hypothetical protein  28.45 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0137581  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3250  GCN5-related N-acetyltransferase  22.42 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  23.84 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
383 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156025  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7586  GCN5-related N-acetyltransferase  25.57 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  25.99 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  23.03 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  27.03 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.03 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  27.03 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  27.03 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  27.03 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  27.03 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  24.34 
 
 
206 aa  45.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 
203 aa  45.4  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>