181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4101 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  70.55 
 
 
202 aa  256  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  70.55 
 
 
179 aa  255  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  70.55 
 
 
183 aa  254  5e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  63.41 
 
 
179 aa  224  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  59.06 
 
 
178 aa  221  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  58.48 
 
 
189 aa  218  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 
176 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  37.09 
 
 
177 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  38.07 
 
 
199 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  37.43 
 
 
199 aa  87.8  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  30.18 
 
 
174 aa  85.1  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  34.93 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  33.99 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
182 aa  81.6  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
198 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  33.99 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  34.83 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
218 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  30.12 
 
 
210 aa  79  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  31.79 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  36.75 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  31.64 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  31.14 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  28.76 
 
 
184 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  32.02 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  28.32 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  31.79 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
173 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
200 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  28.57 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
200 aa  61.6  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
185 aa  60.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  27.89 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  27.89 
 
 
182 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  27.49 
 
 
182 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1358  acetyltransferase  28.95 
 
 
226 aa  57.8  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  28.38 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
182 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1465  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
175 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0333555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2100  hypothetical protein  24.34 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 
206 aa  54.3  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  28.22 
 
 
188 aa  54.3  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  25.73 
 
 
198 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  25.93 
 
 
185 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6180  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
155 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  28.21 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2153  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.59 
 
 
352 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4372  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000439862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  27.95 
 
 
195 aa  51.2  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
198 aa  51.2  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
166 aa  51.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
171 aa  51.2  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  25.52 
 
 
157 aa  50.8  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3988  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
203 aa  50.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1731  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1902  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99979  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06830  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  40.3 
 
 
172 aa  50.4  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6718  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
160 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586463  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4586  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
184 aa  48.1  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1148  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
194 aa  48.1  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  37.93 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.17 
 
 
359 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  hitchhiker  0.00000000407656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  27.71 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1518  GNAT family acetyltransferase  35.23 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000034512  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
179 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2015  hypothetical protein  26.16 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0137581  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0062  GCN5-related N-acetyltransferase  24.03 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0023  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0292  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.238914 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  22.81 
 
 
188 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>