91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05850 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  100 
 
 
352 aa  709    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1893  GCN5-related N-acetyltransferase  52.56 
 
 
165 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.993819  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1902  GCN5-related N-acetyltransferase  51.92 
 
 
182 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99979  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1012  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.52 
 
 
138 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230309 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06380  hypothetical protein  56.82 
 
 
134 aa  152  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00670  hypothetical protein  56.82 
 
 
134 aa  152  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  44.81 
 
 
157 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  51.66 
 
 
322 aa  143  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0069  hypothetical protein  56.15 
 
 
136 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0254  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.07 
 
 
142 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1024  hypothetical protein  52.21 
 
 
150 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47673  normal  0.0221645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1537  hypothetical protein  54.2 
 
 
148 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30430  hypothetical protein  51.88 
 
 
136 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.314754  normal  0.154496 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06830  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  41.18 
 
 
172 aa  126  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.19 
 
 
135 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.16985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6180  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
155 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6181  GCN5-related N-acetyltransferase  44.08 
 
 
155 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3023  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 
167 aa  96.3  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09050  hypothetical protein  44.78 
 
 
142 aa  94.7  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4499  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
156 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2385  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.88 
 
 
156 aa  85.9  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3387  GCN5-related N-acetyltransferase  36.48 
 
 
163 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
163 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0887  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
158 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00152164  normal  0.292323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0991  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 
163 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 
163 aa  84  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3048  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000741101  normal  0.0835188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0924  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1049  acetyltransferase  36.73 
 
 
158 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0607  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
174 aa  79  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  34.34 
 
 
167 aa  59.3  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3398  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.45 
 
 
165 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0084357  normal  0.312955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  30 
 
 
202 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
179 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
181 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  29.19 
 
 
183 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
189 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  34.38 
 
 
181 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
199 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
167 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  hitchhiker  0.00000000407656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
198 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
209 aa  49.7  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
199 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  28.43 
 
 
166 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 
166 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2153  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
184 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
182 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1571  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.37 
 
 
205 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.71775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
200 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0616  acetyltransferase  27.37 
 
 
205 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
173 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01360  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.47 
 
 
178 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
203 aa  48.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
178 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1731  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 
185 aa  47.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.565009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
176 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
174 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1855  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
377 aa  46.6  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175358  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0292  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
169 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.238914 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 
334 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  26.39 
 
 
183 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
178 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  29.81 
 
 
204 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
185 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3509  GCN5-related protein N-acetyltransferase  30.22 
 
 
174 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.417547 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
194 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  28.06 
 
 
178 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0253  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
169 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
180 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
231 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  35.48 
 
 
190 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  35.62 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3359  hypothetical protein  58.62 
 
 
47 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.358076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2715  acetyltransferase, GNAT family  28.09 
 
 
175 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000439711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
180 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  31.94 
 
 
182 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1537  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
180 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
185 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 
189 aa  43.5  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2720  acetyltransferase, GNAT family  29.03 
 
 
175 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2516  acetyltransferase  28.09 
 
 
175 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2701  acetyltransferase  28.09 
 
 
175 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
180 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3076  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.55 
 
 
130 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.601761 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 
182 aa  43.1  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2477  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.09 
 
 
175 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00384778  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2442  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.09 
 
 
175 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 
199 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
173 aa  42.7  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
199 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  28.09 
 
 
189 aa  42.7  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>