114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3048 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3048  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
158 aa  322  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000741101  normal  0.0835188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0887  GCN5-related N-acetyltransferase  94.94 
 
 
158 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00152164  normal  0.292323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0924  GCN5-related N-acetyltransferase  94.9 
 
 
158 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1049  acetyltransferase  78.48 
 
 
158 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  70 
 
 
163 aa  223  6e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3387  GCN5-related N-acetyltransferase  69.33 
 
 
163 aa  222  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  68 
 
 
163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0991  GCN5-related N-acetyltransferase  68 
 
 
163 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3023  GCN5-related N-acetyltransferase  57.72 
 
 
167 aa  173  7e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6180  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
155 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0607  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 
174 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6181  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 
155 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 
157 aa  100  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1902  GCN5-related N-acetyltransferase  41.48 
 
 
182 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99979  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1893  GCN5-related N-acetyltransferase  40.6 
 
 
165 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.993819  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06830  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.69 
 
 
172 aa  84  7e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  38.64 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4499  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  38.1 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  27.81 
 
 
204 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
185 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002738  acetyltransferase  33.71 
 
 
237 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000969588  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  30.99 
 
 
182 aa  50.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
205 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
183 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03244  hypothetical protein  31.82 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
179 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  48.5  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01360  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  27.27 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0186  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
166 aa  48.1  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
178 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1567  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
193 aa  47.8  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 
185 aa  47  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  28.89 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
193 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
198 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
193 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3398  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.14 
 
 
165 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0084357  normal  0.312955 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
203 aa  44.7  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  33.75 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  24.66 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 
347 aa  44.7  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  27.05 
 
 
173 aa  44.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4280  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
188 aa  44.3  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.426403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0478  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
172 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0298  hypothetical protein  29.08 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0408  acetyltransferase-related protein  30.53 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0990149  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  35.83 
 
 
210 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  29.86 
 
 
202 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2633  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.192007  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  22.88 
 
 
180 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  31.72 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  24.5 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  37.65 
 
 
334 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
199 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
179 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  38.3 
 
 
198 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
182 aa  42.4  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  29.37 
 
 
183 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
199 aa  42.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2269  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
199 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.495125 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  32.98 
 
 
180 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13254  transferase  27.5 
 
 
474 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.323872  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  39.66 
 
 
183 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  32.98 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
181 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08650  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.4 
 
 
829 aa  42  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00178935  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  23.31 
 
 
182 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.72 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  27.61 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  35.85 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00230501  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
198 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1456  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.87 
 
 
177 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  29.93 
 
 
184 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  25 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
185 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.69 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  23.72 
 
 
175 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
218 aa  41.2  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  23.31 
 
 
181 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0377  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  31.43 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4288  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
203 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
203 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.171908  normal  0.472025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
176 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3047  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
178 aa  40.8  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0386186  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6718  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>