109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1049 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1049  acetyltransferase  100 
 
 		 158 aa  323  9e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3048  GCN5-related N-acetyltransferase  78.48 
 
 		 158 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000741101  normal  0.0835188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0887  GCN5-related N-acetyltransferase  77.85 
 
 		 158 aa  253  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00152164  normal  0.292323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0924  GCN5-related N-acetyltransferase  76.43 
 
 		 158 aa  247  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  70.13 
 
 		 163 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0991  GCN5-related N-acetyltransferase  70.13 
 
 		 163 aa  231  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3387  GCN5-related N-acetyltransferase  68.83 
 
 		 163 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  70 
 
 		 163 aa  227  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3023  GCN5-related N-acetyltransferase  60.4 
 
 		 167 aa  184  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0607  GCN5-related N-acetyltransferase  42.96 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6180  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6181  GCN5-related N-acetyltransferase  41.73 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1902  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 		 182 aa  93.6  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99979  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1893  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 		 165 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.993819  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06830  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.92 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.73 
 
 		 352 aa  81.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4499  GCN5-related N-acetyltransferase  37.4 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.52802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5179  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  27.78 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1306  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5164  acetyltransferase, putative  25.34 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4734  acetytransferase  27.08 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 		 204 aa  52  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 		 176 aa  51.2  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  35.23 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01360  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.97 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08650  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.68 
 
 		 829 aa  50.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00178935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5169  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  26.21 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2633  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.192007  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  26.03 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  28.03 
 
 		 189 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0079  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  25.69 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2974  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002738  acetyltransferase  30.53 
 
 		 237 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000969588  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0692  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0892137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0162  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4749  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  24.31 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0298  hypothetical protein  28.97 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  29.79 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4036  GCN5-related N-acetyltransferase  37.38 
 
 		 210 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.357695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  31.78 
 
 		 177 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  27.08 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 198 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4461  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0216912  normal  0.010687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  30.11 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  30.69 
 
 		 173 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2625  GCN5-related N-acetyltransferase  33.66 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3047  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0386186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1117  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123993  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 		 369 aa  44.3  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03244  hypothetical protein  30.85 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0791  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.144012 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0775  SSU ribosomal protein S5P alanine acetyltransferase  27.41 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0083  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0457106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  40.3 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4288  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4374  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.171908  normal  0.472025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0949  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  33.01 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0186  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 		 218 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.333102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00230501  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2588  acetyltransferase, GNAT family  22.01 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0609063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 185 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  hitchhiker  0.00000000407656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 		 198 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0618  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 193 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 		 203 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10910  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  27.59 
 
 		 187 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2452  acetyltransferase  24.48 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.765579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4666  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 217 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.868748  normal  0.839586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  30.39 
 
 		 218 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13110  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.37 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.615061  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19930  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  26.53 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.193802  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0676  GCN5-related N-acetyltransferase  28.23 
 
 		 166 aa  41.6  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 		 190 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.88 
 
 		 347 aa  41.2  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  32.32 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 185 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  37.7 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2029  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2638  acetyltransferase, putative  24.26 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.77086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  31.19 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>