177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1202 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
178 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  63.53 
 
 
189 aa  231  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  64.42 
 
 
202 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  64.42 
 
 
179 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  64.42 
 
 
183 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  59.06 
 
 
181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  60.12 
 
 
179 aa  208  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
176 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  33.55 
 
 
177 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
214 aa  85.1  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3248  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
218 aa  82  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
218 aa  81.6  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  31.14 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  31.14 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  29.34 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
231 aa  77.4  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  32.73 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 
200 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  34.52 
 
 
198 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
216 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  30.92 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  29.82 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  31.1 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  28.86 
 
 
198 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  28.76 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  32.24 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
199 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
177 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
176 aa  66.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  28.19 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  29.8 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3353  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  32.48 
 
 
177 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  27.52 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  27.16 
 
 
195 aa  62  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3590  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.249758  normal  0.183758 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
198 aa  60.8  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  30.67 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  26.85 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3435  acetyltransferase  26.17 
 
 
182 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00643707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
157 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
182 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  27.89 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.1 
 
 
179 aa  58.9  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1465  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0333555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  26.09 
 
 
198 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
197 aa  57.8  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1120  hypothetical protein  29.73 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
193 aa  54.3  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0475  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2197  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.963489 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 
182 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0962  hypothetical protein  28.48 
 
 
157 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.397264  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1358  acetyltransferase  25.17 
 
 
226 aa  52.4  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1049  acetyltransferase  31.03 
 
 
158 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  23.94 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  27.7 
 
 
204 aa  51.2  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
203 aa  51.2  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3202  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
194 aa  50.8  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
185 aa  50.1  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  24.04 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1902  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
182 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.99979  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0909  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
376 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
383 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156025  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1206  GCN5-related N-acetyltransferase  21.77 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000216631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0924  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  26.32 
 
 
188 aa  48.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6718  GCN5-related N-acetyltransferase  37.66 
 
 
160 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586463  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3048  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000741101  normal  0.0835188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2442  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
172 aa  47.8  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.351971  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  23.65 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0841  acetyltransferase  29.91 
 
 
181 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.286189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.53 
 
 
352 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2015  hypothetical protein  25 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0137581  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  24.65 
 
 
173 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3391  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  24.82 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0402  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5893  Acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein-like protein  30.13 
 
 
352 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0132303 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>