More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4286 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4286  acetyltransferase  100 
 
 
210 aa  438  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.537934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3007  GCN5-related N-acetyltransferase  74.42 
 
 
221 aa  337  8e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3871  GCN5-related N-acetyltransferase  74.19 
 
 
218 aa  334  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18683  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4195  GCN5-related N-acetyltransferase  74.19 
 
 
218 aa  333  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  58.85 
 
 
231 aa  240  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0282361  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1780  acetyltransferase  60 
 
 
216 aa  239  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1848  acetyltransferase  59.44 
 
 
216 aa  238  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  53.48 
 
 
197 aa  205  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  41.49 
 
 
209 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
198 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  40.84 
 
 
213 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  40.31 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  40.21 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  41.21 
 
 
199 aa  127  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  38.22 
 
 
199 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  37.3 
 
 
200 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  36.22 
 
 
195 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  35.68 
 
 
202 aa  111  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
198 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
199 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1481  GCN5-related N-acetyltransferase  40.27 
 
 
174 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  31.89 
 
 
199 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  33.69 
 
 
199 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_002936  DET0144  acetyltransferase  33.52 
 
 
184 aa  95.5  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.660916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1891  acetyltransferase  30.61 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 
185 aa  89  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 
176 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163456  normal  0.836234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  31.11 
 
 
195 aa  85.9  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
176 aa  84.7  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001022  putative acetyltransferase  34.67 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0192  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0873  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
187 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07104  acetyltransferase  31.17 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_152  acetyltransferase, GNAT family  35.2 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  29.14 
 
 
175 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1011  acetyltransferase, GNAT family  30.67 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  29.34 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.221931  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  29.8 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  28.48 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  28.48 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01621  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 
204 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.112063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2860  acetyltransferase, GNAT family  30.2 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.8 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430017  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  31.95 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
182 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
185 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0399  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0456  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1120  hypothetical protein  33.76 
 
 
173 aa  72  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2464  acetyltransferase  31.03 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422249  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2282  acetyltransferase  27.57 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.519455  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  28.48 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3398  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.39 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0084357  normal  0.312955 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  30.72 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0271  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  28.04 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6902  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.770732  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  30.72 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0298  hypothetical protein  31.13 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.05 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0442  acetyltransferase  28.85 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00386351  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.49 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
167 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0766  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1173  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
195 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2358  acetyltransferase  28.57 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.503993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2534  acetyltransferase  28.57 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.178562  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  27.43 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.294894  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  28.57 
 
 
347 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1192  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0681319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2100  hypothetical protein  24.28 
 
 
186 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5747  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.020842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
173 aa  63.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3126  acetyltransferase  29.41 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.731723  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5253  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
205 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107453  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
189 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3425  acetyltransferase, gnat family  29.41 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>