More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4644 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
347 aa  712    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2101  hypothetical protein  52.84 
 
 
179 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.306871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1121  hypothetical protein  53.71 
 
 
179 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0648  hypothetical protein  50.85 
 
 
209 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3542  hypothetical protein  48.86 
 
 
177 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0944  hypothetical protein  47.73 
 
 
177 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246134  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0761  hypothetical protein  52.69 
 
 
180 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3167  hypothetical protein  51.23 
 
 
184 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0816  hypothetical protein  45.68 
 
 
178 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.98756  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0056  hypothetical protein  41.53 
 
 
184 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.149965  hitchhiker  0.00268422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3791  hypothetical protein  37.57 
 
 
174 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0468047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3790  hypothetical protein  41.57 
 
 
176 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0977946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4411  hypothetical protein  36.57 
 
 
175 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02420  hypothetical protein  38.29 
 
 
177 aa  109  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987106  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0535  hypothetical protein  34.87 
 
 
179 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2931  hypothetical protein  32.39 
 
 
179 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00911801  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0268  hypothetical protein  32.04 
 
 
182 aa  87.4  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0831  hypothetical protein  30.72 
 
 
175 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452667  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3923  hypothetical protein  28 
 
 
176 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0111  hypothetical protein  33.89 
 
 
176 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.714642  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1249  hypothetical protein  29.22 
 
 
223 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0784897  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03110  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  31.17 
 
 
154 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3423  hypothetical protein  32.03 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2380  hypothetical protein  29.14 
 
 
155 aa  75.9  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000493372  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1024  hypothetical protein  28.21 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  34.18 
 
 
200 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
181 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.21 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  29.59 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  29.22 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1219  Polyketide cyclase/dehydrase  29.33 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.48 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
190 aa  68.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3707  hypothetical protein  29.38 
 
 
191 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0408785 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.56 
 
 
179 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
189 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  28.4 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  31.25 
 
 
184 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1803  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
166 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
180 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4577  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
166 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000162939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
183 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  35.1 
 
 
182 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  27.15 
 
 
175 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  27.15 
 
 
175 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  27.15 
 
 
175 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2047  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  32.03 
 
 
529 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5418  GCN5-related N-acetyltransferase  26.25 
 
 
164 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  27.74 
 
 
189 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
181 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
175 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 
189 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
192 aa  63.5  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
175 aa  62.8  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1640  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2495  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0262  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  27.21 
 
 
171 aa  62.8  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0295  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.642002  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1443  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
207 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
185 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06848  acetyltransferase  29.56 
 
 
183 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
196 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
167 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  25.54 
 
 
187 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  27.62 
 
 
188 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.9 
 
 
185 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 
195 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  26.52 
 
 
178 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
173 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0220  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
183 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0394642  hitchhiker  0.00447894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1771  acetyltransferase, GNAT family  37.4 
 
 
175 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  28.08 
 
 
182 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0850928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.49 
 
 
175 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
170 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 
166 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
176 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
189 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
168 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
185 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  27.74 
 
 
186 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
206 aa  60.5  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.4 
 
 
168 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  24.59 
 
 
195 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
181 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1501  GCN5-related N-acetyltransferase  29.22 
 
 
180 aa  59.7  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 
194 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  30.46 
 
 
601 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  27.63 
 
 
185 aa  59.7  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
170 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001595  hypothetical protein  29.33 
 
 
309 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00208101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
180 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
180 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1509  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 
185 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  29.03 
 
 
187 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  26.32 
 
 
190 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  30.2 
 
 
188 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>