More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0820 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
180 aa  377  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  57.56 
 
 
171 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  55.81 
 
 
171 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  48.02 
 
 
178 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  44.77 
 
 
177 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
177 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  44.97 
 
 
190 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  47.59 
 
 
174 aa  158  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  42.26 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  41.04 
 
 
207 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  41.04 
 
 
207 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  41.04 
 
 
336 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  40.23 
 
 
204 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  40.23 
 
 
204 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  40.46 
 
 
225 aa  140  8e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  36.84 
 
 
176 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
178 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7056  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
179 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6557  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
175 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6271  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1388  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
176 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6159  GCN5-related N-acetyltransferase  39.2 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.887134  normal  0.0717303 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6553  GCN5-related N-acetyltransferase  39.2 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676437  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1278  GCN5-related N-acetyltransferase  39.2 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  36.54 
 
 
181 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
207 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  37.09 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  34.3 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0068  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  36.13 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
169 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  31.52 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  34.75 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4498  acetyltransferase, GNAT family  36.14 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4446  acetyltransferase  34.91 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.949941  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4109  acetyltransferase  34.91 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4445  acetyltransferase, GNAT family  34.91 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4593  acetyltransferase  34.91 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  32.68 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4098  acetyltransferase  34.91 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4261  acetyltransferase  34.32 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4484  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.93 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  33.88 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0752  acetyltransferase, GNAT family  34.34 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  32.45 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  31.76 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00124051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.38 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  31.33 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  31.82 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3081  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.7 
 
 
179 aa  64.3  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1789  GCN5-related protein N-acetyltransferase  32.05 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal  0.254544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3804  hypothetical protein  27.15 
 
 
188 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0689439  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  28.67 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  28.48 
 
 
189 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  32.26 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1984  acetyltransferase, GNAT family  29.49 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.819298  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  32.26 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
187 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  28.85 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  28.85 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.85 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  28.85 
 
 
176 aa  62  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5000  GCN5-related N-acetyltransferase  31.37 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3517  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  28.66 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17840  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  31.17 
 
 
359 aa  61.2  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  23.81 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  28.19 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.85 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  31.79 
 
 
196 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  32.05 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  29.41 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  31.01 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  32.5 
 
 
184 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>