169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2605 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2605  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.463816  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0350  hypothetical protein  78.61 
 
 		 201 aa  337  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0752  GCN5-related N-acetyltransferase  49.4 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0754  GCN5-related N-acetyltransferase  44.71 
 
 		 179 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0351  GCN5-related N-acetyltransferase  43.75 
 
 		 171 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.988966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1051  hypothetical protein  45.35 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0753  acetyltransferase  41.42 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2712  GCN5-related N-acetyltransferase  45.35 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.757846  normal  0.0335255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0178  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3879  GCN5-related N-acetyltransferase  43.9 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332564  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0755  acetyltransferase  40.94 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0352  acetyltransferase  37.79 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2713  putative acetyltransferase  39.77 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.699108  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0177  acetyltransferase  40.24 
 
 		 178 aa  122  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1052  acetyltransferase  39.18 
 
 		 178 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  37.35 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0346868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 167 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.57312  normal  0.0127804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 		 194 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1058  hypothetical protein  34.57 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0202  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  36.81 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1050  acetyltransferase  38.41 
 
 		 186 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0179  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 		 186 aa  91.7  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0751  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  37.59 
 
 		 180 aa  87.8  9e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0317  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 		 184 aa  85.9  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1431  acetyltransferase  37.67 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  35.62 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2711  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.764957  normal  0.0336934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4585  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2827  hypothetical protein  31.21 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1793  hypothetical protein  29.71 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.53536  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2226  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.572683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2326  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3625  hypothetical protein  29.76 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.134616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4082  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.418613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1193  acetyltransferase  32.24 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1115  acetyltransferase  32.24 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2397  acetyltransferase  32.24 
 
 		 336 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.287178  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0820  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350892  normal  0.227447 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0671  acetyltransferase  31.58 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.300648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0794  acetyltransferase  31.58 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1758  acetyltransferase  31.58 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0244  GNAT family acetyltransferase  28.07 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6271  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6557  GCN5-related N-acetyltransferase  32.24 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7056  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  30.07 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.45 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  28.76 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  30.67 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  28.1 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.76 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0037  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  28.76 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  27.98 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  28.76 
 
 		 175 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  31.03 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  30 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0445  hypothetical protein  28.38 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  27.44 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  29.11 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153843  normal  0.249566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3114  acetyltransferase  24.66 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1187  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.773581 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3043  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1278  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6553  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6159  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.887134  normal  0.0717303 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  26.35 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3269  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2860  acetyltransferase, GNAT family  28.57 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.25 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 		 174 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  30.41 
 
 		 178 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7126  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 		 177 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1388  GCN5-related N-acetyltransferase  32.87 
 
 		 176 aa  51.6  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  28.14 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  29.66 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  29.86 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  26.57 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  24.85 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  25.34 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>