More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4661 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  91.53 
 
 
189 aa  359  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  81.28 
 
 
189 aa  316  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  72.49 
 
 
189 aa  292  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  70.74 
 
 
189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  70.21 
 
 
190 aa  279  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  70.06 
 
 
178 aa  266  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  60.77 
 
 
186 aa  220  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  54.64 
 
 
187 aa  201  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  53.67 
 
 
178 aa  197  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  53.55 
 
 
195 aa  195  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  55.19 
 
 
190 aa  193  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  52.22 
 
 
196 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  52.22 
 
 
196 aa  191  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  53.01 
 
 
195 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  52.22 
 
 
192 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  51.67 
 
 
188 aa  186  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  50.27 
 
 
181 aa  177  7e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  50.55 
 
 
184 aa  177  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  48.07 
 
 
190 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  46.11 
 
 
188 aa  175  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  48.09 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  51.48 
 
 
185 aa  169  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  48.33 
 
 
183 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
184 aa  168  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  49.43 
 
 
185 aa  166  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  43.78 
 
 
186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  47.78 
 
 
186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  43.58 
 
 
189 aa  161  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  47.22 
 
 
204 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  47.34 
 
 
187 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  44.51 
 
 
181 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  44.2 
 
 
194 aa  159  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
177 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  44.51 
 
 
188 aa  151  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  45.66 
 
 
182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  45.09 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  47.98 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  45.55 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
296 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  43.26 
 
 
180 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  46.47 
 
 
318 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  42.7 
 
 
191 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  40.8 
 
 
185 aa  127  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  47.26 
 
 
146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  42.61 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  39.55 
 
 
182 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  39.08 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  46.46 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  42.2 
 
 
285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  37.22 
 
 
180 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  37.22 
 
 
180 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 
170 aa  109  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
182 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  37.22 
 
 
207 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 
178 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  33.52 
 
 
192 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  32.57 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
174 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  30.77 
 
 
201 aa  88.6  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  32.6 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3051  GCN5-related N-acetyltransferase  29.44 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 
176 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
185 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  30.13 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  30.32 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  28.89 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  31.58 
 
 
202 aa  81.3  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  29.11 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  28.89 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.89 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  29.05 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.48 
 
 
181 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  29.11 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3009  acetyltransferase, GNAT family  28.89 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  34.04 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  28.89 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  28.89 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.38 
 
 
175 aa  79  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  28.33 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  28.89 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.33 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.75 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  31.98 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
165 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.33 
 
 
179 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>