More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3711 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  100 
 
 
195 aa  396  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  54.1 
 
 
189 aa  197  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  53.55 
 
 
189 aa  195  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  55.37 
 
 
188 aa  194  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  54.86 
 
 
178 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  53.23 
 
 
185 aa  192  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  56.57 
 
 
195 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  52.25 
 
 
187 aa  185  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  52.57 
 
 
196 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1932  GCN5-related N-acetyltransferase  56.91 
 
 
190 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  51.37 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  53.18 
 
 
192 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  53.04 
 
 
192 aa  181  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  52 
 
 
196 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  49.73 
 
 
185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  47.59 
 
 
194 aa  176  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  52.25 
 
 
181 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  48.3 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  46.89 
 
 
182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  45 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  47.19 
 
 
190 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  45.76 
 
 
182 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  47.19 
 
 
189 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  47.95 
 
 
178 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  50.28 
 
 
204 aa  167  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  40.64 
 
 
186 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  50.3 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  48.02 
 
 
184 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  49.73 
 
 
188 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  50.59 
 
 
177 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  42.93 
 
 
189 aa  158  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  44.13 
 
 
181 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  43.96 
 
 
190 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3721  GCN5-related N-acetyltransferase  49.72 
 
 
186 aa  154  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  46.15 
 
 
188 aa  152  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  44.75 
 
 
180 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  47.22 
 
 
318 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  47.95 
 
 
183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  41.34 
 
 
184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
191 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4398  GCN5-related N-acetyltransferase  45.09 
 
 
185 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5570  GCN5-related N-acetyltransferase  44.77 
 
 
189 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144352  hitchhiker  0.00667719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0788  acetyltransferase  54.55 
 
 
172 aa  139  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.195926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4532  GCN5-related N-acetyltransferase  50.59 
 
 
296 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682837  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4730  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000259757  normal  0.0193485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3637  GCN5-related N-acetyltransferase  44.19 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00282394  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1047  GCN5-related N-acetyltransferase  46.51 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000189696  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3303  GCN5-related N-acetyltransferase  47.92 
 
 
146 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  46.43 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000328938  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 
176 aa  121  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  38.51 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0719  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00418587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0703  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 
180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  43.68 
 
 
285 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.338216  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  45.52 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
182 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
185 aa  93.6  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
178 aa  92.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
174 aa  85.9  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  35.17 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  38.26 
 
 
179 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.95 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0871  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.703911 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20860  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.89 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  31.62 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 
165 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  31.13 
 
 
171 aa  78.6  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  30.57 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  31.84 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  31.41 
 
 
165 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.06 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  28.98 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  31.13 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  30.94 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  32.07 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  33.11 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4735  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.43909  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5650  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  28.16 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>