More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3606 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
174 aa  363  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  70.76 
 
 
175 aa  259  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  63.31 
 
 
176 aa  241  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  59.3 
 
 
174 aa  223  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  62.72 
 
 
178 aa  222  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  44.94 
 
 
181 aa  144  5e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
166 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  39.41 
 
 
165 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
166 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
165 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
165 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
165 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  35.93 
 
 
174 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
165 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  37.72 
 
 
165 aa  104  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  37.13 
 
 
165 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
170 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
170 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  36.47 
 
 
188 aa  99  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
171 aa  98.2  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  37.25 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  33.33 
 
 
201 aa  97.1  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
165 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
169 aa  95.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.0203096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  34.64 
 
 
165 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
170 aa  90.9  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.630016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
190 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
165 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
167 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
167 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
167 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1507  putative acetyltransferase  33.78 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.209579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
167 aa  85.9  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  35.12 
 
 
168 aa  85.1  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  32.21 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  36.08 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  31.54 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2744  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  30.87 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  30.87 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.54 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1059  GCN5-related N-acetyltransferase  33.15 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000184612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
196 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4577  GCN5-related N-acetyltransferase  32.92 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000162939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3519  acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein  37.5 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.420967  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  30.87 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.2 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.06 
 
 
396 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  29.7 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2032  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0442  acetyltransferase  31.37 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00386351  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3536  acetyltransferase  30.77 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0443  acetyltransferase  31.61 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0378222  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3517  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.77 
 
 
167 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1823  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  34.19 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3228  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  30.77 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1733  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.46 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0110114 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1733  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  31.28 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1955  acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.557592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1688  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.67 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3474  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  30.61 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  30.61 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1738  acetyltransferase  32.67 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1714  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.67 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000230477  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13328  acetyltransferase, GNAT family protein  29.73 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248311  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1876  acetyltransferase  32.67 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05693  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.05 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  29.34 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1911  acetyltransferase, GNAT family  32.67 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.138005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1868  acetyltransferase, GNAT family  32.67 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  33.78 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  31.85 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  33.78 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000080  putative acetyltransferase  30.86 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  30.32 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  33.78 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  31.52 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  33.56 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  29.82 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>