More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3519 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3519  acetyltransferase including N-acetylase of ribosomal protein  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.420967  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  49.64 
 
 
201 aa  136  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2550  GCN5-related N-acetyltransferase  39.22 
 
 
181 aa  94.7  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  34.3 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
178 aa  91.7  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
166 aa  89  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
174 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
175 aa  87.8  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  35.86 
 
 
174 aa  87.8  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
165 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  36.94 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
165 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1936  acetyltransferase  34.04 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  35.26 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  40.69 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  35.95 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2895  acetyltransferase, GNAT family  30.57 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2876  acetyltransferase  29.94 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0284819  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  39.13 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
167 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2656  acetyltransferase  29.3 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00207068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2847  acetyltransferase  29.3 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.657353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3561  putative acetyltransferase  40 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.743687  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  34.16 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  34.64 
 
 
195 aa  77  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2607  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.94 
 
 
175 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  30.72 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1783  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
190 aa  77  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3255  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  31.25 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  37.24 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  31.46 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3046  acetyltransferase  33.79 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0847366  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1460  acetyltransferase  37.01 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.176845  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  32.64 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  31.94 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2798  acetyltransferase  33.1 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3008  acetyltransferase, GNAT family  33.1 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000400809 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  33.1 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  36.55 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2268  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2853  acetyltransferase, GNAT family  28.66 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00067342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.1 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.776721  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  31.29 
 
 
183 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2860  acetyltransferase, GNAT family  30.67 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  35.86 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52235  normal  0.630016 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2575  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.66 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.240858  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  36.3 
 
 
185 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  32.41 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  33.11 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 
185 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  29.61 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  31.13 
 
 
174 aa  68.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12850  acetyltransferase  32.53 
 
 
192 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.82898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4545  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0445  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
176 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.159299  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  34.03 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  29.71 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  31.21 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.72 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  35.81 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
173 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4634  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
206 aa  67  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.490299  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1743  GCN5-related N-acetyltransferase  34.51 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2232  acetyltransferase, GNAT family  31.72 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000183087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>