More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3770 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  100 
 
 
131 aa  267  4e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  94.66 
 
 
131 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0659  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  75.38 
 
 
134 aa  202  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  72.66 
 
 
132 aa  194  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  60 
 
 
134 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  58.4 
 
 
128 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  58.4 
 
 
128 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  58.4 
 
 
128 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0154  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  53.91 
 
 
131 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000120622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  53.12 
 
 
131 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  53.12 
 
 
131 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0349436  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  53.12 
 
 
131 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0153  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  53.12 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471922  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0107  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  51.59 
 
 
132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000992989  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0104  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  51.59 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000574829  normal  0.261189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0105  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50.78 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000458525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00100  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase, marked preference for dGTP  50.78 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.126012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3501  mutator MutT protein  50.78 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00099  hypothetical protein  50.78 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.146865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3558  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50.78 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.016637  hitchhiker  0.00136766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0093  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50 
 
 
129 aa  124  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0101  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50 
 
 
129 aa  124  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708829  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  47.66 
 
 
132 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0645  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  50.82 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62648  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  42.19 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  46.22 
 
 
329 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  46.22 
 
 
329 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  41.94 
 
 
132 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  48.39 
 
 
317 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  45.67 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  43.44 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1156  mutator MutT protein  40 
 
 
126 aa  110  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000464506  normal  0.12144 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  43.44 
 
 
130 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  41.41 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  43.44 
 
 
130 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  43.65 
 
 
130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  43.2 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  43.2 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  41.6 
 
 
134 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  42.4 
 
 
132 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.26 
 
 
313 aa  107  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  43.44 
 
 
314 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  40.8 
 
 
130 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  44.26 
 
 
316 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  42.62 
 
 
130 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  40.32 
 
 
133 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  44.8 
 
 
128 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  44.53 
 
 
136 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  41.13 
 
 
134 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  42.62 
 
 
314 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  42.62 
 
 
314 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  42.62 
 
 
314 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  40.16 
 
 
129 aa  102  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  40 
 
 
132 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  42.28 
 
 
317 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  43.55 
 
 
319 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  43.22 
 
 
310 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  39.53 
 
 
131 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  42.62 
 
 
313 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  38.93 
 
 
137 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  42.97 
 
 
132 aa  99.4  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3395  mutator mutT protein  43.22 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  38.93 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  41.54 
 
 
329 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  40.98 
 
 
316 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
151 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  39.68 
 
 
318 aa  99.4  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  41.6 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4453  mutator mutT protein  40.15 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0347377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
133 aa  98.6  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  36.59 
 
 
131 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.98 
 
 
314 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.2 
 
 
135 aa  98.2  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  44.07 
 
 
306 aa  97.4  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  41.41 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  41.41 
 
 
132 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.67 
 
 
321 aa  96.7  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004482  MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  40.77 
 
 
132 aa  96.7  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
133 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  37.69 
 
 
132 aa  95.9  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  39.84 
 
 
315 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  40.52 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
146 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40.5 
 
 
325 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  41.27 
 
 
314 aa  95.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  40.65 
 
 
315 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.3 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  40.62 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  35.94 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  39.84 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  35.94 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
142 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  40.16 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  38.46 
 
 
144 aa  94  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  40 
 
 
322 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  41.88 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  41.96 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  39.5 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>