More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1428 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  100 
 
 
138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  100 
 
 
138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  99.28 
 
 
138 aa  276  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  98.55 
 
 
138 aa  275  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  98.55 
 
 
138 aa  275  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  77.78 
 
 
135 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  77.78 
 
 
135 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 
135 aa  214  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  77.78 
 
 
135 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  77.78 
 
 
135 aa  214  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  77.04 
 
 
135 aa  213  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  77.04 
 
 
135 aa  213  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  76.3 
 
 
135 aa  207  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  73.19 
 
 
140 aa  202  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  61.42 
 
 
133 aa  156  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  65.87 
 
 
128 aa  154  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  65.87 
 
 
128 aa  154  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  65.87 
 
 
128 aa  154  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  47.9 
 
 
132 aa  101  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  42.06 
 
 
318 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  47.5 
 
 
134 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  41.86 
 
 
130 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  41.86 
 
 
130 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  44.19 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  44.19 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  41.86 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
169 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  47.15 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  42.74 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  41.09 
 
 
130 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  46.43 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  46.61 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  46.61 
 
 
132 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  42.24 
 
 
302 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
132 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  43.28 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  44.78 
 
 
144 aa  94.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  46.61 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  43.41 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  43.75 
 
 
314 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  43.28 
 
 
142 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.6 
 
 
315 aa  93.2  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  41.6 
 
 
315 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  41.94 
 
 
135 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
129 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  43.9 
 
 
320 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1102  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.142351  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  46.83 
 
 
132 aa  91.3  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  43.9 
 
 
320 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  42.4 
 
 
316 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  41.8 
 
 
130 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  41.6 
 
 
313 aa  90.5  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  42.34 
 
 
321 aa  90.5  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  43.8 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
135 aa  90.1  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  36.89 
 
 
129 aa  90.1  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  41.6 
 
 
313 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  39.06 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  39.53 
 
 
132 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  40.83 
 
 
306 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  41.6 
 
 
316 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  44.7 
 
 
314 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
138 aa  88.6  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.18 
 
 
314 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  39.06 
 
 
132 aa  89  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 
139 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
334 aa  88.6  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.17 
 
 
129 aa  88.2  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
133 aa  87.8  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.88 
 
 
314 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 
138 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.44 
 
 
314 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2084  hypothetical protein  42.74 
 
 
319 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.15 
 
 
314 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2025  mutator MutT protein  40.65 
 
 
322 aa  86.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  36.43 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0410  mutator mutT protein  37.5 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  40.15 
 
 
316 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  42.15 
 
 
317 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  41.38 
 
 
312 aa  85.1  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
149 aa  84.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  38.02 
 
 
134 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 
138 aa  84  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2711  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  35.94 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  34.88 
 
 
131 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  43.7 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  40.8 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>