More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2984 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  100 
 
 
136 aa  274  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  60.48 
 
 
154 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  57.89 
 
 
141 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  60.16 
 
 
138 aa  166  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  61.67 
 
 
133 aa  164  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
147 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  56 
 
 
139 aa  139  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  52.8 
 
 
138 aa  130  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 
141 aa  124  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
134 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  42.62 
 
 
132 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
133 aa  103  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
130 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
130 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  42.19 
 
 
136 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 
137 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  40.32 
 
 
134 aa  100  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 
126 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  39.84 
 
 
139 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  37.5 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
131 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  36.64 
 
 
131 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  36.64 
 
 
131 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  39.67 
 
 
129 aa  90.9  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  38.79 
 
 
137 aa  90.5  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
206 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
143 aa  89.4  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
129 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
129 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  38.58 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  45.9 
 
 
313 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.06 
 
 
360 aa  87  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.8 
 
 
314 aa  86.7  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  41.53 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  41.18 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  41.8 
 
 
314 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.98 
 
 
316 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  41.18 
 
 
137 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 
135 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  41.8 
 
 
314 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  41.53 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.16 
 
 
314 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  42.86 
 
 
132 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  39.34 
 
 
316 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  43.31 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.98 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  40.34 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  39.66 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.37 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  40.83 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  33.07 
 
 
131 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0100  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3948  mutator MutT protein  37.69 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  33.85 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3925  mutator MutT protein  36.92 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  40.98 
 
 
320 aa  80.1  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4066  mutator MutT protein  36.92 
 
 
130 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.72 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  40.98 
 
 
320 aa  79.7  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  36.92 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  36.92 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  38.89 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  36.92 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  40.8 
 
 
329 aa  80.1  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.72 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.97 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.72 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
137 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.97 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  36.72 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  41.46 
 
 
315 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.07 
 
 
352 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  36.97 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  40.16 
 
 
313 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  36.15 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.64 
 
 
396 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  37.9 
 
 
136 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
169 aa  77  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>