More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0634 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 143 aa  301  2.0000000000000002e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  42.86 
 
 		 139 aa  107  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  41.22 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  48.41 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  42.86 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  39.06 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 131 aa  91.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0325  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.849393  normal  0.626146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  34.88 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 154 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  42.62 
 
 		 136 aa  83.6  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  41.6 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  35.83 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.1 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.9 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  35.66 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  38.93 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  41.91 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  41.54 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  37.69 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  37.69 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  40.17 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  36.57 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  36.57 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  38.71 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  38.71 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  40 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  39.06 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 316 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  37.06 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  30.47 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  39.85 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  36.57 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  38.79 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  38.79 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  38.64 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  39.52 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  36.72 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  39.06 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 		 200 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.51 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.51 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.21 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  38.84 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  36.84 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  36.43 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  37.6 
 
 		 313 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>