More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3099 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  100 
 
 
137 aa  288  2e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
154 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
138 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
141 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
133 aa  106  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
138 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 
138 aa  102  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
128 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  38.1 
 
 
136 aa  97.4  5e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  39.52 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  39.52 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  36.89 
 
 
132 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 
147 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
137 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
139 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
129 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  36.67 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3510  mutator MutT protein  35.43 
 
 
130 aa  84  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.39786  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.28 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  34.45 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  28.8 
 
 
131 aa  77.4  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  38.02 
 
 
129 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  37.69 
 
 
314 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.88 
 
 
133 aa  77  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  37.69 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.69 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  34.07 
 
 
317 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.71 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  34.43 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.52 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03249  mutator mutT protein  36 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  36.15 
 
 
314 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3429  mutator MutT protein  38.46 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
132 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  33.88 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0592  hypothetical protein  38.58 
 
 
316 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  33.59 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.2 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  35.14 
 
 
570 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  37.19 
 
 
317 aa  71.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  36 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  32.81 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  35.25 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  33.59 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0149  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.6 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  hitchhiker  0.00538151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  33.91 
 
 
302 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0146  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.6 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.71 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3873  mutator MutT protein  35.54 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  31.67 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  32.8 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
267 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  35.04 
 
 
320 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  36.44 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  34.43 
 
 
316 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  32.26 
 
 
142 aa  67  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.54 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.51 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  31.09 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1971  mutator MutT protein  32.28 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.027425  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.51 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.15 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1170  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000110534  normal  0.0271169 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.51 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  32.06 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  32.06 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.15 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.15 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  29.51 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>