More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4321 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  100 
 
 
291 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  51.91 
 
 
200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  55.47 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  54.76 
 
 
124 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
148 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
132 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
132 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 
132 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  56.03 
 
 
130 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
169 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 
206 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  52.59 
 
 
128 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  50.4 
 
 
144 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  52.5 
 
 
141 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  48.67 
 
 
145 aa  98.2  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 
166 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  48.09 
 
 
570 aa  95.5  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  46.43 
 
 
147 aa  94.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 
153 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 
153 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  50.86 
 
 
151 aa  92.8  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  45.99 
 
 
156 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 
167 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  50.81 
 
 
145 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  49.59 
 
 
132 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  51.2 
 
 
133 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  44.58 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  45.69 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
128 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
138 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
130 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  33.06 
 
 
132 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
130 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  32.9 
 
 
386 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.05 
 
 
129 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
138 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
138 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  34.53 
 
 
142 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
139 aa  74.3  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
147 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
129 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  40.17 
 
 
133 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1760  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
134 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
141 aa  71.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
132 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.83 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  38.83 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  40.65 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  35.83 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.86 
 
 
135 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
138 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
143 aa  68.2  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.11 
 
 
133 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
129 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  30.97 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  36.69 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  58.06 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  43.75 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.23 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 
126 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  56.45 
 
 
132 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  34.81 
 
 
131 aa  65.1  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  56.45 
 
 
132 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  32.2 
 
 
131 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  32.2 
 
 
131 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  59.32 
 
 
132 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2380  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
169 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.39 
 
 
132 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
136 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2204  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
141 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  53.97 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
133 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.89 
 
 
135 aa  63.9  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 
138 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 
138 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
134 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  33.91 
 
 
131 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  40.52 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  38.69 
 
 
347 aa  63.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  40.52 
 
 
329 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 
138 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 
138 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  40.38 
 
 
473 aa  62.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  33.61 
 
 
134 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.23 
 
 
138 aa  62.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  36.94 
 
 
400 aa  62.8  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  48.48 
 
 
137 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  57.63 
 
 
135 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  49.21 
 
 
142 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  34.96 
 
 
139 aa  62.4  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>