More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0863 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  100 
 
 
153 aa  286  8e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  69.7 
 
 
167 aa  171  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  52.76 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  51.18 
 
 
128 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 
200 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  52.31 
 
 
147 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  52.46 
 
 
128 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
132 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1131  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 
132 aa  97.8  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  48.85 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0183  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  49.26 
 
 
291 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
169 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  49.56 
 
 
145 aa  94  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
132 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3865  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 
156 aa  92  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal  0.664134 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 
267 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0048  NUDIX hydrolase  49.17 
 
 
166 aa  90.1  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.393224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
134 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 
124 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  44.63 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 
132 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  50 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1077  NUDIX hydrolase  51.15 
 
 
244 aa  85.5  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  50.44 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  48 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  38.84 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  47.2 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  47.2 
 
 
132 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14530  ADP-ribose pyrophosphatase  50 
 
 
170 aa  84  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
129 aa  84.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  42.28 
 
 
131 aa  84.3  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  44 
 
 
570 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  44 
 
 
132 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  39.52 
 
 
386 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  46.4 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  41.6 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  41.6 
 
 
142 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  42.31 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  42.65 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  42.4 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  41.94 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  43.65 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  44.54 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  43.2 
 
 
136 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  44.09 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  39.67 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  35.96 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  38.33 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  40.32 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  44.83 
 
 
138 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  40.32 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40.5 
 
 
325 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  41.6 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  43.08 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  39.52 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  38.02 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  38.02 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
154 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  34.68 
 
 
352 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  40 
 
 
347 aa  73.9  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  41.6 
 
 
314 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  40.8 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  35.77 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.68 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  35.77 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  40.8 
 
 
314 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  42.4 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.58 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  43.1 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  40.62 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  38.71 
 
 
138 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  40.8 
 
 
314 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  44.64 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  38.46 
 
 
302 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  38.84 
 
 
314 aa  71.2  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  44.64 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  35.83 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>