More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0910 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 141 aa  293  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  74.02 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  71.2 
 
 		 138 aa  197  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  57.89 
 
 		 136 aa  167  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  59.02 
 
 		 133 aa  164  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  54.4 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 		 128 aa  114  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  41.32 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 138 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  38.76 
 
 		 132 aa  103  7e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  42.19 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 126 aa  100  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.94 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  39.84 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  39.84 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.52 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  39.02 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.69 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.69 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.69 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  37.69 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2293  mutator MutT protein  40.52 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.192428  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.69 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.69 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  36.64 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 137 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.92 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  39.2 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  40.68 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 		 133 aa  87.4  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  37.19 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  40.68 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 		 143 aa  86.7  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11430  ADP-ribose pyrophosphatase  37.21 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.250404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  40.17 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 		 129 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.68 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  40.34 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  40.34 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  41.38 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  39.32 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  39.84 
 
 		 318 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 144 aa  83.6  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  39.83 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  35.16 
 
 		 360 aa  81.6  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  38.89 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  42.28 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  37.61 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  38.71 
 
 		 316 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  37.9 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  36.51 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  37.9 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  38.76 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  37.6 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  38.02 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  39.13 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  37.9 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  37.9 
 
 		 314 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  39.52 
 
 		 313 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  38.98 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  38.98 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4091  hypothetical protein  36.29 
 
 		 316 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  38.14 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  38.14 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  39.34 
 
 		 320 aa  77.4  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  39.34 
 
 		 320 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  33.59 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>