More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2568 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  100 
 
 
130 aa  264  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2568  NUDIX hydrolase  100 
 
 
130 aa  264  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  79.07 
 
 
132 aa  210  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3078  NUDIX hydrolase  59.38 
 
 
134 aa  160  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  50.38 
 
 
136 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1031  putative mutator mutT protein  48.46 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0898  mutator MutT protein, putative  48.46 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0730911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  45.6 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  43.9 
 
 
154 aa  105  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
129 aa  103  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
136 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
129 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
129 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
129 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
141 aa  100  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2684  CTP pyrophosphohydrolase  45.45 
 
 
134 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00235226  normal  0.16537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  37.1 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 
141 aa  94  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  39.84 
 
 
131 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0755  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
267 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0414471  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  37.3 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2457  putative mutT-like protein  37.69 
 
 
147 aa  90.1  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
138 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.51 
 
 
135 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3770  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
200 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.51 
 
 
135 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  84.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.16 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 
138 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4152  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
128 aa  84.3  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0641206  decreased coverage  0.0000968848 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.34 
 
 
140 aa  84  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0742  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
169 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.478674 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.92 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.92 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.92 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  37.69 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
128 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3099  mutator protein; oxidative damage repair protein  33.61 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0863  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.522755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3270  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196596  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  37.6 
 
 
139 aa  80.1  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0979  NUDIX hydrolase  39.34 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.353962 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4272  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841219  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4043  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.62945  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  34.96 
 
 
132 aa  80.1  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4118  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  34.92 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  30.47 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2654  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  32 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  33.33 
 
 
302 aa  77.8  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4548  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
148 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223367  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  33.86 
 
 
133 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  32 
 
 
318 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
206 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
129 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4321  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 
291 aa  77  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  32.8 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  32.8 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  36.13 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  34.4 
 
 
347 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1863  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.477977  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  33.6 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.33 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32.8 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  32.54 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11185  mutator protein mutT  36.89 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0122522  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2491  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  31.78 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  36.94 
 
 
352 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  32.76 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31180  ADP-ribose pyrophosphatase  32.54 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.3856  normal  0.753153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>